基于生物信息学途径探究肝癌关键枢纽基因

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摘要 摘要:目的 通过生物信息学途径,筛选肝癌差异表达基因,评估蛋白质相互作用并分析关键基因,从而寻找肝癌关键肿瘤标志物。方法 从GEO数据库中寻找与肝癌相关的数据芯片GSE32958,筛选并分析肝脏非肿瘤组织与肝肿瘤组织之间的差异表达基因(DEGs);利用DAVID在线数据库对 DEGs 行KEGG通路富集分析和GO功能富集;使用在线分析网站STRING和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用PPI网络,并分析其Top10关键基因。结果 得到由54个上调基因,140个下调基因组成的194个差异表达基因,通过蛋白质相互作用网络筛选出ASS1,TIMP1,ASL,GPT,SDS,IGF1,FTCD,AASS,ANXA5,CTH 10个关键基因,它们可作为肝癌关键肿瘤标志物,为早期监测肝癌病情发展提供可靠指标。结论 获取更多与肝癌发生转化相关的分子机制的生物学信息,作为肝癌预后的生物标志物以及潜在的肝癌治疗的分子靶点,并为临床剖析肝癌肿瘤标志物制定或更改最优的治疗方案。
出处 《科技新时代》 2022年5期
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出版日期 2022年07月12日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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