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  • 简介:摘要目的探讨3-羟基-3-甲基辅酶A合成2缺乏症(HMGCS2D)患儿的临床特征和基因变异。方法总结中山大学附属第六医院儿科确诊的1例HMGCS2D患儿临床表现、实验室检查及基因检测等临床资料,并以"3-羟基-3-甲基辅酶A合成2缺乏症"、"低酮性低血糖"、"HMGCS2D"、"HMGCS2基因"为关键词,对中国知网、万方数据知识服务平台及PubMed 1970年1月至2020年1月收录的论文进行检索。总结HMGCS2D患儿的临床表现和基因特点。结果患儿,女,7个月,因"反复呕吐10h,反应差6h"入院。患儿表现为呕吐、昏睡、肝肿大、低血糖、重度代谢性酸中毒,尿有机酸分析发现多种元羧酸、4-羟基-6-甲基-2-吡喃酮(4-hydroxy-6-methyl-2-pyrone,4HMP)升高。基因检测发现该受检者HMGCS2基因存在两个杂合突变,c.758T>T(p.V253A)和c.1175C>T(p.S392L),分别遗传自患儿的父亲和母亲,其均为杂合状态。检索到相关文献14篇(26例),加上本文1例共27例患儿。主要表现为长期饥饿或感染诱发的低血糖、昏迷,实验室检查提示低酮、尿中元羧酸升高,均检测到HMGCS2基因突变,从而确诊。结论HMGCS2D是一种遗传性代谢紊乱,由HMGCS2基因突变导致,临床表现特异性不高,患儿尿液中升高的4HMP可能为该病的特异性标志物,目前诊断依赖于基因检测,饮食控制(避免饥饿、碳水化合物的补充)可减少代谢危象的发生。

  • 标签: 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合成酶2缺乏症 HMG-CoA合成酶2 HMGCS2基因 低酮性低血糖
  • 作者: 孙隽 黄颐 王小冬 李文甫 安冬艳 高勇 熊慧 周在威 许雄 邓旭旭 王小清 黄辉 彭智宇 张巍 于世辉 汪亮 顾卫红 黄尚志 沈亦平
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2020-08-13
  • 出处:《中华医学遗传学杂志》 2020年第03期
  • 机构:天津华大医学检验所有限公司 300308;深圳华大基因股份有限公司,广东 518083,上海集爱遗传与不育诊疗中心 200011,赛福解码(北京)基因科技有限公司,北京 100080,北京聚道科技有限公司 100083,北京金准基因科技有限责任公司 100083,北京希望组生物科技有限公司 102200,厦门基源医学检测有限公司,福建 360000,上海寻因生物科技有限公司 201800,湖南大地同年生物科技有限公司,长沙 410205,北京贝瑞和康生物技术有限公司 102206,上海瀚垚生物医学科技有限公司 201318,深圳华大基因股份有限公司,广东 518083,广州嘉检医学检测有限公司 510300,广州金域医学检验中心有限公司 510000,深圳基因界科技咨询有限公司,广东 518000,中文人类表型标准用语联盟/中日友好医院神经内科运动障碍与神经遗传病研究中心,北京 100029,北京协和医学院、世界卫生组织遗传病社区控制合作中心 100005,哈佛大学医学院波士顿儿童医院,美国波士顿 MA 02115;广西妇幼保健院广西儿童医院,南宁 530000
  • 简介:摘要基因组测序数据的生物信息学分析以及变异的临床相关性解读是基于代测序的遗传病诊断全流程的核心内容。本文探讨了生物信息学分析、数据存储和数据解读环节的流程、功能、主要参数指标及建议等,经行业内临床医师、检测实验室等相关专家讨论,对符合孟德尔遗传规律的胚系突变的遗传病规范化检测达成了共识,以期为提高基于代测序的遗传病诊断的同质性和可靠性提供指导。

  • 标签: 二代测序 生物信息学分析流程 数据储存 数据质量控制 变异解读
  • 简介:摘要目的比较足月小于胎龄(SGA)新生儿和与之配对的足月适于胎龄儿(AGA)血氨基酸和基肉碱的差异,探讨足月SGA血代谢谱的变化,为临床干预提供依据。方法选择2018年1月至12月在中山大学附属第六医院出生的79例足月SGA为研究对象,同期在本院出生的按胎龄、性别匹配的79例健康足月AGA为对照,出生后第3天采集干血滤纸片样品进行串联质谱分析,应用正交偏最小乘判别分析(OPLS-DA)寻找2组间的差异和生物标志物。结果足月SGA组出生体质量(2.5±0.2) kg,足月AGA组出生体质量(3.2±0.3) kg。通过OPLS-DA模型分析发现12种权重较大的血代谢物质及2组血代谢物比值分别为:丙基肉碱(0.34±0.13比0.42±0.15)、酪氨酸[0.24(0.18,0.27)比0.28(0.22,0.37)]、游离肉碱(0.43±0.14比0.37±0.12)、缬氨酸[0.39(0.35,0.45)比0.44(0.36,0.53)]、辛基肉碱(0.33±0.13比0.29±0.09)、肉豆蔻基肉碱(0.35±0.12比0.31±0.10)、丁基肉碱(0.37±0.13比0.41±0.14)、3-羟基基肉碱[0.35(0.25,0.43)比0.35(0.26,0.45)]、葵基肉碱(0.26±0.13比0.23±0.08)、异戊烯基肉碱[0.33(0.26,0.34)比0.33(0.30,0.35)]、亮氨酸[0.38(0.30,0.47)比0.40(0.33,0.48)]、甲硫氨酸(0.42±0.14比0.46±0.15),其中丙基肉碱(t=3.920)、酪氨酸(Z=3.536)和缬氨酸(Z=2.838)在足月SGA组明显降低,而游离肉碱(t=-2.863)、辛基肉碱(t=-2.266)和肉豆蔻基肉碱(t=-2.194)明显升高,与足月AGA组相比差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论足月SGA新生儿出生后早期血液中氨基酸和基肉碱水平与足月AGA存在差异。足月SGA新生儿营养支持中需适量补充芳香族氨基酸和支链氨基酸;其出生后早期通过动员中长链脂肪酸来满足机体能量代谢。

  • 标签: 氨基酸 酰基肉碱 代谢谱 小于胎龄儿 足月 婴儿,新生
  • 简介:摘要目的运用基于目的基因捕获的高通量测序技术对新生儿进行常见遗传病基因检测,了解新生儿常见遗传病的发病率及相关基因致病变异的携带率和变异类型,探讨该技术在新生儿遗传病筛查中的应用价值。方法收集2019年6月至2020年4月广东地区出生的1 793例新生儿足跟血,采用基于目的基因捕获的高通量测序技术对138个新生儿常见遗传病相关基因的外显子区域进行检测,变异致病性的解读基于《遗传变异分类标准与指南(2017)》,其中已知致病和可能致病纳入阳性变异,采用Sanger测序技术对阳性变异位点进行验证,并采用计数方法对检测结果进行分析。结果1 793例新生儿中,男978例,女815例;共筛出阳性158例,阳性率为8.81%,检测出阳性病种11种。在阳性病种中,常染色体隐性耳聋1A型41例(2.29%),Gilbert综合征或Crigler-Najjar综合征40例(2.23%),葡萄糖-6-磷酸脱氢(G6PD)缺乏症33例(1.84%),家族性高胆固醇血症19例(1.06%),钠牛磺胆酸共转运多肽缺陷病18例(1.00%),线粒体非综合征型耳聋2例(0.11%),Citrin缺乏症2例(0.11%),全羧化合成缺乏症、β-珠蛋白生成障碍性贫血、异染性脑白质营养不良各1例(各占0.06%)。972例携带1个或多个基因的阳性变异位点,共涉及85种疾病,其中携带率较高的疾病为Gilbert综合征或Crigler-Najjar综合征(359例,20.02%)、常染色体隐性耳聋1A型(302例,16.84%)和钠牛磺胆酸共转运多肽缺陷病(291例,16.22%),其高频变异位点为UGT1A1基因c.211G>A位点、GJB2基因c.109G>A位点和SLC10A1基因c.800C>T位点。结论广东地区新生儿常见遗传病为常染色体隐性耳聋1A型、Gilbert综合征或Crigler-Najjar综合征、G6PD缺乏症、家族性高胆固醇血症和钠牛磺胆酸共转运多肽缺陷病,且存在人群高频携带位点;探索性地对新生儿常见遗传病进行基因筛查,可为新生儿基因筛查的开展积累数据和经验。

  • 标签: 高通量测序技术 基因 新生儿筛查 遗传病 变异
  • 作者: 王剑 顾卫红 黄辉 沈亦平 熊慧 黄颐 祁鸣 安冬艳 马端 邓旭旭 高勇 王小冬 周在威 伍健 许雄 张巍 康辉 彭智宇 于世辉 汪亮 黄尚志
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2020-08-13
  • 出处:《中华医学遗传学杂志》 2020年第03期
  • 机构:上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心 200127,中文人类表型标准用语联盟/中日友好医院神经内科运动障碍与神经遗传病研究中心,北京 100029,深圳华大基因股份有限公司,广东 518083,哈佛大学医学院波士顿儿童医院,美国波士顿 MA 02115;广西妇幼保健院广西儿童医院,南宁 530000,厦门基源医学检测有限公司,福建 360000,上海集爱遗传与不育诊疗中心 200011,浙江大学医学院附属第一医院/邵逸夫医院,杭州 310058;浙江迪安诊断技术股份有限公司,杭州 310013;罗切斯特大学医学中心,美国纽约 NY 14642,北京金准基因科技有限责任公司 100083,复旦大学出生缺陷研究中心,上海 200433,北京贝瑞和康生物技术有限公司 102206,北京希望组生物科技有限公司 102200,赛福解码(北京)基因科技有限公司 100080,上海寻因生物科技有限公司 201800,北京迈基诺基因科技股份有限公司 101318,湖南大地同年生物科技有限公司,长沙 410205,广州嘉检医学检测有限公司 510300,深圳华大生命科学研究院,广东 518083,广州金域医学检验中心有限公司 510000,深圳基因界科技咨询有限公司,广东 518000,北京协和医学院、世界卫生组织遗传病社区控制合作中心 100005
  • 简介:摘要遗传检测前的准备工作是基因检测的基础和出发点,其流程包括临床信息收集、检测方案拟定、检测前遗传咨询以及知情同意书和检测委托书的填写等。临床若能有效识别出遗传性疾病,可极大提高代测序的诊断率,从而降低医疗成本,提高临床诊疗的功效。代测序结果的分析在很大程度上依赖于对基因型-表型相关性的了解,全面准确地采集和评估临床表型,并用统一的标准术语来描述和记录尤为重要。不同类型的遗传病或突变种类需要用特定的检测手段方能事半功倍。检测前遗传咨询能够帮助患者及其亲属了解相关基因检测的意义并协助制定个体化的检测策略,为后续的跟踪随访奠定基础。

  • 标签: 二代测序 表型术语 基因型 检测前遗传咨询 知情同意
  • 作者: 曾秀凤 许振朋 黄辉 屈武斌 伍建 王娟 高勇 安冬艳 王小清 熊慧 沈亦平 祁鸣 邓旭旭 许雄 孙乐乐 彭智宇 顾卫红 黄尚志 于世辉
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2020-08-13
  • 出处:《中华医学遗传学杂志》 2020年第03期
  • 机构:明码(上海)生物科技有限公司 200131,深圳华大基因股份有限公司,广东 518083,艾吉泰康生物科技(北京)有限公司 102206,北京迈基诺基因科技股份有限公司 101318,安诺优达基因科技(北京)有限公司 100176,北京希望组生物科技有限公司 102200,北京金准基因科技有限责任公司 100083,上海瀚垚生物医学科技有限公司 201318,厦门基源医学检测有限公司,福建 360000,哈佛医学院波士顿儿童医院,美国波士顿 MA 02115;广西妇幼保健院广西儿童医院,南宁 530000,浙江大学医学院附属第一医院/邵逸夫医院,杭州 310058;浙江迪安诊断技术股份有限公司,杭州 310013;罗切斯特大学医学中心,美国纽约 NY 14642,北京贝瑞和康生物技术有限公司 102206,湖南大地同年生物科技有限公司,长沙 410205,中文人类表型标准用语联盟,中日友好医院神经内科运动障碍与神经遗传病研究中心,北京 100029,北京协和医学院、世界卫生组织遗传病社区控制合作中心 100005,广州金域医学检验中心有限公司 510000
  • 简介:摘要代测序技术(next generation sequencing,NGS)具有极高的检测通量,相对低的检测成本,高度的准确性(accuracy)和精准性(precision),是遗传病临床检测的有力工具之一。NGS实验室的检测流程是否规范,将直接影响NGS数据的稳定性、可靠性和有效性,将决定其是否能被用于遗传病的临床辅助诊断或筛查。因此,作为遗传病基因检测的重要环节之一,NGS实验室中流程的规范化与标准化非常重要。2019年5月,在第基因检测联盟会议上,针对如何规范NGS检测流程,从事遗传病临床诊治、实验室检测以及第三方基因检测机构的专家进行了全面充分的讨论,旨在规范基于NGS的基因检测流程,对检测流程中的前、中、后三个阶段(包括样本采集/接收/保存、NGS建库、上机测序及数据质控)的操作与实施提出了专业性的指导意见,以规范NGS技术在遗传病基因检测领域中的应用。本文根据此次研讨会上各行业专家的讨论,总结并发布NGS实验室检测流程的规范共识,以促进NGS实验室流程的规范化和标准化,推进我国NGS实验室在遗传病基因检测领域的快速和专业化发展。

  • 标签: 二代测序 样品采集 建库 数据质控
  • 作者: 黄辉 沈亦平 顾卫红 黄颐 王小冬 高勇 熊慧 周在威 吴静 马端 安冬艳 张巍 傅琴梅 熊茜 彭智宇 汪亮 黄尚志 祁鸣
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2020-08-13
  • 出处:《中华医学遗传学杂志》 2020年第03期
  • 机构:深圳华大基因股份有限公司,广东 518083,哈佛大学医学院波士顿儿童医院,美国波士顿 MA 02115;广西妇幼保健院广西儿童医院,南宁 530000,中文人类表型标准用语联盟/中日友好医院神经内科运动障碍与神经遗传病研究中心,北京 100029,上海集爱遗传与不育诊疗中心 200011,赛福解码(北京)基因科技有限公司 100080,北京希望组生物科技有限公司 102200,厦门基源医学检测有限公司,福建 360000,上海寻因生物科技有限公司 201800,复旦大学出生缺陷研究中心,上海 200433,北京金准基因科技有限责任公司 100083,广州嘉检医学检测有限公司 510300,深圳华大生命科学研究院,广东 518083,深圳基因界科技咨询有限公司,广东 518000,北京协和医学院、世界卫生组织遗传病社区控制合作中心 100005,浙江大学医学院附属第一医院/邵逸夫医院,杭州 310058;浙江迪安诊断技术股份有限公司,杭州 310013;罗切斯特大学医学中心,美国纽约 NY 14642
  • 简介:摘要临床基因检测的结果在遗传分析环节由数据解读人员整理成一份规范的基因检测报告,提供给临床医师及受检者(若受检者有智力障碍或者为未成年人,则检测报告提供给其父母或法定监护人)。检测报告的内容应遵循相关标准及/行业共识。临床医师将综合基因检测报告及临床指征进一步诊断其所患疾病。遗传咨询师应协助临床医师及受检者或其亲属,提供检测后的遗传咨询服务。在知情同意的前提下建立检测后的跟踪随访机制。数据应由临床医疗机构与第三方检测机构共享,补充的回访数据可以帮助进一步评估报告结果,因此检测机构应定期对既往的检测报告数据及后续的回访数据进行整理分析,并同新的分析结果同步提交给患者和医疗机构。所有涉及报告、遗传咨询、后续跟踪回访及分析结果更新的活动均应遵循相关的法律法规。

  • 标签: 临床基因检测 基因检测报告 遗传咨询 跟踪随访 法律法规