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  • 简介:摘要目的通过对1株从1名被海虾刺伤的患者脓分离的致病菌株JM-1进行准确鉴定、药敏试验和毒力基因分析,为海岸嗜半胱氨酸(Cysteiniphilum litorale)作为罕见病原体引起临床相关感染的筛检及改善预后提供实验依据。方法对分离株进行生化表型鉴定、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定、16S rRNA基因测序和系统发育分析,以及基于全基因组序列的平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)、平均氨基酸一致性(average amino acid identity,AAI)分析和系统发育分析,以准确确定其分类学地位;以E-test法进行药敏试验,并依据CLSI M45-A3土拉弗朗西斯解释标准进行结果判读;以VFDB毒力因子数据库对全基因组进行毒力基因注释和分析。结果分离株JM-1在哥伦比亚血平板上培养3 d可见灰白色、中等大小、光滑、圆形、凸起的溶血菌落。革兰染色为着色较淡的阴性球杆菌。API NH鉴定结果提示为卡他莫拉(生化编码:3010);Vitek2系统NH卡鉴定无鉴定结果(生物编码:0211002121)。EXS3000质谱仪自建库数据库鉴定为海岸嗜半胱氨酸。基于16S rRNA基因和全基因组的系统发育分析均表明该菌株与海岸嗜半胱氨酸DSM 101832T聚类为同一个小的分支,且两者之间的全基因组ANI和AAI值分别为95.07%和95.65%。药敏试验显示分离株JM-1产β-内酰胺酶和青霉素酶,对青霉素耐药,对庆大霉素、链霉素、强力霉素、四环素、环丙沙星、左氧氟沙星、氯霉素敏感。从分离株JM-1基因组注释到了与弗朗西斯相似的毒力基因:弗朗西斯致病岛(FPI)、Ⅳ型菌毛、荚膜和脂多糖等。结论海岸嗜半胱氨酸是一种具有弗朗西斯毒力相关基因罕见病原体,且其药敏特性亦与弗朗西斯相类似。本案例确认了一例由海岸嗜半胱氨酸引起的临床感染,自建库的MALDI-TOF质谱系统可用于其快速鉴定。

  • 标签: 海岸嗜半胱氨酸菌 分类鉴定 药敏 毒力基因