简介：摘要呼吸道感染是人群的常见和高发疾病，严重时可发展为ARDS。各类病原微生物如细菌、真菌、病毒，均可引起呼吸道感染，快速准确的病原检测是实现呼吸道感染疾病有效诊治的关键，但超过50%的患者未能诊断出明确的致病微生物。近年来，以临床宏基因组学、CRISPR（成簇规律间隔的短回文重复序列）为代表的新型检测技术在病原诊断领域取得了迅速发展，在提高病原检出率的同时，也带来了新的挑战。本文综述了过去1年来呼吸道感染病原诊断领域的进展和成果，为呼吸道感染的病原诊断提供临床视角的思考。

简介：摘要儿童细菌性脑膜炎感染可引起严重的并发症和后遗症，肺炎链球菌是该病重要的病原体，早期快速明确感染的病原体，对于精准治疗、降低其病死率和减少后遗症均有重要意义。近年来，分子生物学方法的快速进展使临床病原的诊断模式发生了巨大改变。现主要从肺炎链球菌脑膜炎病原体诊断进展方面进行阐述，以更加系统地了解新兴技术的发展在肺炎链球菌脑膜炎精确诊断中的作用。

简介：摘要目的为指导小儿细菌性肺炎抗生素的合理使用，探讨小儿细菌肺炎的主要致病菌及其耐药性。方法我们近9年对住院的肺炎小儿行痰培养,99年后的培养方法是培养基自配，细菌鉴定以法国梅里埃公司提供的API鉴定条，药敏试验采用法国梅里埃公司提供的ATB药敏板条。结果本资料细菌出率（267/1365）19.56%细菌依次为大肠埃希氏菌86例（32.2%），葡萄球菌58例（21.72%），其中金黄色葡萄球菌27例，表皮葡萄球菌23例，腐生葡萄球菌8例肺炎克雷伯氏菌41例（15.36%）假单包菌22例（8.24%）链球菌18例（6.74%）流感嗜血杆菌10例（3.74%）；沙雷氏菌属12例（4.49%）；肠杆菌属8例（3.0%）；肠球菌8例（3.0%）。

简介：摘要目的探讨本地区小儿腹泻的病原菌分布，流行趋势及细菌耐药等情况。方法对我院07年9月到09年9月期间住院及门诊临床诊断为感染性腹泻的466例儿童粪便标本作病原菌分离培养、鉴定和药敏试验，并进行回顾性分析。结果从466例小儿腹泻粪便标本中，分离出病原菌164株，总检出率为35.2%，以肺炎克雷伯菌检出率为最高，164株病原菌中，检出率最高的是婴儿期，其次是幼儿期。腹泻的病原菌可见于各个季节，但有明显的季节高峰期，夏季检出率最高为38.6%。本次肠道菌药敏试验结果显示，耐药率高的有氨苄西林78.5%，还有哌拉西林54.1%，三四代头孢类药物敏感性高。结论条件致病菌目前是小儿腹泻的主要病原菌，头孢类药物可作为经验性治疗腹泻的首选药物，避免滥用抗生素。

简介：摘要肺炎的病原学诊断极易误诊和漏诊，是临床和实验室的共同关注点。本文拟对成人社区获得性肺炎、医院获得性肺炎、免疫受损患者肺炎的病原学检查、病原谱、注意事项、报告等进行综述。

简介：摘要目的分析社区获得性肺炎病原学诊断的临床特点。方法选择我院自2012年6月至2015年1月收治的189例CAP患者的临床资料，对全部患者进行痰培养病理学检测及肺炎支原体抗体检测。结果117例患者松病原体为阳性，阳性率61.9%，其中，共检出病原体123株，其中肺炎支原体占比最高，为22.8%。其中18例患者共出2种及以上病原体混合感染，占比15.4%，患者中，合并慢性阻塞性肺疾病为109例，占比57.7%，为最高。结论肺炎链球菌是CAP最常见的病原体，合并呼吸系统疾病的患者为CAP的易感人群，在筛查时应注意。

简介：摘要目的评价降钙素原（procalcitonin, PCT）血清浓度鉴别诊断血流感染（bloodstream infection, BSI）病原学的准确性。方法收集2015年1月至2020年6月于中日友好医院重症监护室（ICU）诊断为BSI且阳性血培养同时进行PCT检测的患者资料，以血培养当天的参数计算序贯器官衰竭评分（sequential organ failure assessment, SOFA），比较不同病原体感染者之间各指标的差异，并用受试者工作特征（receiver operating characteristic, ROC）曲线分析生物标志物PCT对单一病原体感染的鉴别诊断价值。结果在1 456例BSI患者中，单一细菌或念珠菌感染分别为1261例（86.6%）和80例（5.5%），混合感染115例（7.9%）；28 d病死率为24.5%（356/1 456），60 d病死率为30.6%（446/1 456）；无论28 d还是60 d病死率，混合感染组均明显高于细菌菌血症组以及念珠菌血症组。PCT在革兰阴性菌（gram-negative bacteria, GNB）菌血症中显著高于革兰阳性菌（gram-positive bacteria, GPB）菌血症和念珠菌血症｛3.4 μg/L [95%可信区间（95%CI）0.7~17.0 μg/L]比1.3 μg/L（95%CI 0.4~7.3 μg/L）；3.4 μg/L（95%CI 0.7~17.0 μg/L）比1.1 μg/L（95%CI 0.4~3.4 μg/L）；P<0.01｝。ROC曲线分析显示：①PCT鉴别诊断单一细菌菌血症与念珠菌血症的最佳截断值为7.25 μg/L，特异性可达90.0%，ROC曲线下面积（area under ROC curve, AUROC）为0.612（95%CI 0.533~0.691）；当PCT>0.51 μg/L，诊断细菌菌血症的敏感性可达73.3%；②PCT鉴别诊断GNB菌血症与念珠菌血症的最佳截断值为7.32μg/L，特异性为90.0%；AUROC为0.695（95%CI 0.614~0.776）；当PCT>0.51 μg/L时，诊断GNB菌血症的敏感性为84.9%；③PCT鉴别诊断GNB菌血症与GPB菌血症的最佳截断值为0.52 μg/L，敏感性为84.9%，AUROC为0.713（95% CI 0.672~0.755）；当PCT>7.36 μg/L，诊断GNB菌血症的特异性可达80.1%。结论PCT能够提供BSI患者可能的病原学方面的额外信息，尤其是较高的PCT水平往往提示GNB菌血症可能。

简介：摘要：

简介：摘要社区获得性肺炎(community acquired pneumonia，CAP)是5岁以下儿童死亡的重要原因，病毒和细菌均是常见病因。目前关于儿童CAP病原精准诊断仍是临床中的挑战。临床中病原诊断主要通过采集各类样本(如鼻咽拭子、痰、血液、体液等)进行病原检测，如抗原、抗体、培养、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction，PCR)检测等。不同样本及不同检测方法各有优劣，尤其是病毒性肺炎和细菌性肺炎的诊断，对于治疗措施存在很大差异。为了早期识别不同病原，减少抗生素的不合理应用，临床医生及科研工作者仍在不断探索早期准确的病原诊断。代谢组学是一个快速发展的领域，它旨在识别和量化所有代谢物的浓度变化或模型系统中的代谢组。大多数疾病状态与代谢稳态有关，代谢组学能为发现新的生物标记物提供线索，也用于不同病原体所致感染的研究，非靶向代谢组学分析为儿童CAP的病因学提供新的诊断思路。

简介：摘要呼吸系统感染性疾病是临床常见病和多发病。临床上用于疾病病原学诊断的方法很多，各种方法之间存在一定的交叉性和互补性。在充分复习文献和国内外相关研究进展的基础上，结合我国目前的实际情况，编写本专家意见，旨在规范标本的采集、储存、运输、检测过程，提高对感染性呼吸道标本检测效率和准确率,同时对各种检验方法的结果判读进行归纳总结，为临床治疗方案的选择提供帮助。

简介：摘要：本文旨在探讨分子诊断技术应用对提升结核病病原学诊断率的作用分析。观察两种不同的诊断方式对于结核分枝杆菌分型情况及结核菌耐药率的影响。方法本次研究共选取2020年1月-2020年12月间我中心初诊肺结核疑似病例或者临床病例371例，均为痰涂片阴性的371例，并对其进行DNA实时荧光定量PCR方法及改良罗氏培养诊断。同时对这些疾病的影像学表现情况及治疗效果等方面展开回顾性对比研究。经过DNA实时荧光定量PCR方法的诊断，共有371例初诊为肺结核疑似病例或临床病例的患者被确诊为分子生物学阳性病例，其中47例为培养阳性病例。相较于涂片镜检和改良罗氏培养，DNA实时荧光定量PCR方法表现出更高的阳性检出率。同时还发现不同类型肺结核患者之间存在明显差异。在肺结核疑似病例或临床病例的诊断过程中，实时进行DNA实时荧光定量PCR方法，能够显著提高诊断效果，具有广泛的推广价值。

简介：摘要目的分析浙江省肺结核病例病原学诊断率相关因素，为结核病防控提供科学依据。方法从中国疾病预防控制结核病专报信息系统中获取2015年至2020年浙江省各地级市的肺结核病原学检测信息，分析肺结核病例病原学阳性检出情况，构建Joinpoint回归模型评估年度病原学阳性率变化趋势，采用线性回归模型分析新诊断技术对涂阴肺结核病例中病原学阳性检出率的影响。结果2015年至2020年浙江省肺结核病原学阳性率从38.66%(10 588/27 385)上升至64.12%(14 275/22 262)，年均增长率达到8.80%。浙江省11个地级市肺结核病原学阳性率均呈增长趋势，其中温州市和丽水市的年均增长率分别达到10.27%和11.21%，2020年金华市和丽水市病原学阳性率达到70.13%(2 007/2 862)和73.34%(707/964)。2015年至2020年浙江省涂阴肺结核病例占比为61.66%(92 935/150 733)，进一步开展培养或分子检测率从0.13%(22/16 650)上升至84.74%(11 384/13 434)，涂阴肺结核患者病原学确诊阳性率从0.04%(6/16 650)上升至41.28%(5 546/13 434)。如果将培养和分子检测率提高至100.00%，线性回归模型预测病原学阳性率可提高至44.20%，据此估算浙江省肺结核病原学阳性率将达到66.00%。截至2020年，浙江省95.56%(86/90)和92.22%(83/90)的结核病定点医院分别配置了分子诊断设备和液体诊断设备，分子诊断和培养诊断检测阳性的病例在病原学阳性肺结核病例中的占比分别为71.24%(10 169/14 275)和53.44%(7 629/14 275)。结论实施和推广结核病新诊断技术，特别是分子诊断技术，可显著提升肺结核病原学阳性率，结核病防控应更加重视结核病病原学诊断的方法和策略。

简介：

简介：摘要猴痘(monkeypox，MPX)是由猴痘病毒(monkeypox virus，MPXV)引起的一种人畜共患病，它的重新出现是全球潜在的威胁。自2022年5月7日人类MPX阳性病例在英国被发现以来，世界大多数MPX非流行国家报告的阳性病例不断增加，成为突发公共卫生事件，引起全球关注。了解MPX病原学特征、传播途径、致病机制、疫苗和抗病毒药物对猴痘的防治防控有重要意义。本文旨在对MPXV病原学特征及防控措施进行简要阐述。

简介：

简介：

简介：摘要目的探讨病理组织中的病原学检查对结核病的诊断价值。方法选择2016年5月至2019年5月深圳市第三人民医院收治的190例疑似或确诊为结核病患者的病理标本，将190份标本按照病理形态分为4组：组1为坏死性肉芽肿组(109份)，组2为非坏死性肉芽肿组(20份)，组3为普通炎症组(45份)，组4为非结核病变组(16份)。比较各种病原学检测方法在4组病理标本中检出结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis，MTB)的阳性率，同时比较不同抗结核治疗时间对病原学检查结果的影响。统计学方法采用χ2检验或Fisher确切概率法。结果在组1、组2、组3和组4患者的组织病理标本中抗酸染色的阳性率分别为17.4%(19/109)、5.0%(1/20)、4.4%(2/45)、0(0/16)，MTB培养的阳性率分别为32.0%(32/100)、4/19、4.8%(2/42)、0(0/16)，结核分枝杆菌/利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测体系(Mycobacterium tuberculosis/rifampin resistance real-time quantitative nucleic acid amplification detection system, Xpert MTB/RIF)检测的MTB阳性率分别为74.3%(81/109)、15.0%(3/20)、13.3%(6/45)、0(0/16)，荧光定量聚合酶链反应(fluorescent quantitative polymerase chain reaction，FQ-PCR)检测的MTB阳性率分别为63.0%(58/92)、0(0/15)、2.6%(1/38)、0(0/10)，实时荧光核酸恒温扩增检测(simultaneous amplification and testing, SAT)的MTB阳性率分别为32.4%(24/74)、0(0/10)、0(0/15)、0(0/10)，各种病原学方法检测4组标本中的MTB阳性率差异均有统计学意义(均P<0.05)。Xpert MTB/RIF检测组1标本中MTB的阳性率高于抗酸染色、MTB培养和SAT，差异均有统计学意义(χ2＝71.016、37.162、35.679，均P<0.01)，但与FQ-PCR比较差异无统计学意义(χ2＝2.517，P＝0.112)，联合病原学检查MTB的阳性率为85.3%(93/109)，高于Xpert MTB/RIF的74.3%(81/109)，差异有统计学意义(χ2＝4.100，P＝0.043)。各种病原学检查抗结核治疗时间≤1个月与>1个月的组1病理标本MTB阳性率分别为：抗酸染色为14.3%(7/49)比20.0%(12/60)(χ2＝0.612, P＝0.434)，MTB培养为48.9%(22/45)比18.2%(10/55)(χ2＝10.721，P＝0.001)，Xpert MTB/RIF为69.4%(34/49)比78.3%(47/60)(χ2＝1.131，P＝0.287)，FQ-PCR为55.0%(22/40)比69.2%(36/52)(χ2＝1.965，P＝0.161)，SAT为43.3%(13/30)比25.0%(11/44)(χ2＝2.736，P＝0.098)。结论MTB病原学检查结果与典型的结核病病理形态学存在一致性。病理组织的各种病原学检查方法中以Xpert MTB/RIF检出率最高，且不受早期抗结核治疗时间的影响，而联合病原学检查能提高检出率，可在标本量足够时采用。

简介：目的探讨儿童慢性化脓性中耳炎脓性分泌物的病原菌分布和药物敏感性,指导临床用药。方法对271例慢性化脓性中耳炎的分泌物（439耳）进行病原菌培养及药敏试验。结果439耳分泌物标本中病原菌检出率为90.7%（398耳）;需氧菌检出率为71.5%（314耳）,厌氧菌检出率为19.1%（84耳）;革兰阳性菌对环丙沙星（91.8%）和头孢他啶（90.2%）最敏感;革兰阴性菌对氧氟沙星（93.4%）和阿米卡星（88.1%）最敏感,对厌氧菌最敏感的药物为甲硝唑（93.2%）和氧氟沙星（94.3%）。结论金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、铜绿假单胞菌和无芽孢厌氧菌是衡阳地区慢性化脓性中耳炎的主要致病菌。

简介：摘要当前新型冠状病毒肺炎在全世界广泛蔓延。疫情早期，中国政府及时与世界卫生组织积极合作开展病原学研究，并取得一系列成果。新型冠状病毒碱基序列与2002-2003年引起重症急性呼吸综合征的严重急性呼吸综合征冠状病毒具有79%一致性。随着对新型冠状病毒结构和新型冠状病毒肺炎疾病特点认识的逐步深入，研究人员开发出不同的诊断方法，并陆续推出适于当时疫情防控与救治的诊断与治疗方案。至今，国内相关的诊疗方案已有8个版本。本综述将重点阐述新型冠状病毒的病原学特点，并根据疫情的不同阶段着重阐述诊断方法演进和相关临床研究，期望对该种新型传染性疾病有更清晰的认知。

简介：【摘要】目的：研究分析结核病诊断中应用不同病原学检查方法的效果。方法：研究对象为我院2018年4月-2020年12月收治的106例确诊结核病患者，每例患者取1份组织标本，其中52份坏死性肉芽肿组织标本为A组，25份非坏死性肉芽肿组织标本为B组，29份普通炎症组织标本为C组，均采用不同病原学方法进行检测。结果：A组病理标本在不同病原学检查方法中阳性检出率均高于B组、C组（