简介：

简介：摘要肠道病毒（enterovirus，EV）可引起多种感染性疾病，临床表现复杂多样。作为RNA病毒，EV的RNA依赖的RNA聚合酶缺乏校对功能，导致其基因发生高频率的突变和重组，从而使EV获得进化优势，进而发生对宿主的免疫逃逸、对抗病毒药物的抗性，也可使病毒的传播力和致病性增强或组织嗜性发生改变。本文综述了EV的重组机制，并对部分重要型别和新型别EV的重组情况以及重组对病毒流行、致病性的影响进行了概述。

简介：摘要本文通过国内外文献的阅读分析，对乙肝病毒基因型发现及发展，基因型分型测试主要方法，病毒基因的分布区域，变异与临床表现，做了简要综述。

简介：摘要诺如病毒是引起急性胃肠炎的主要病原体之一，极易突变和重组，型别众多。研究早期采用VP1区氨基酸序列对诺如病毒进行分型及鉴定。由于处在或接近聚合酶和衣壳区的重叠区为重组发生的热点区域，因此国际上提出使用聚合酶和衣壳区的双区域分型系统。目前基于2 s标准的双区域分型方法，聚合酶区可分为10个基因组及76种基因型，包括2个暂定基因组及16种暂定基因型，VP1可分为12个基因组及53种基因型，包括2个暂定基因组及5种暂定基因型。暂定基因组和基因型有待进一步型别鉴定和基因组划分。本文对诺如病毒分子特征、不同分型方法的原理、序列扩增方法、在线分型工具及最新的基因分型研究进展进行综述。

简介：摘要目的通过对地区慢性乙型肝炎患者HBV病毒基因分型、耐药突变基因的检测，明确其基因型，确认患者是否耐药，从而指导临床抗病毒治疗。方法采用荧光定量PCR和基因芯片反向斑点杂交技术检测102例慢性乙型肝炎患者血清HBV基因型和耐药突变基因型。结果102例慢性乙型肝炎患者中（1）血清HBVDNA定量为（4.5±2.3）×103～（5.8±1.5）×108copies/ml（2）HBV基因型C型77例占77.5％，B型24例占23.5％，D型1例约占1％（3）其中79例未采取过核苷（酸）类药物抗病毒治疗的患者未出现耐药，23例使用过核苷（酸）类药物抗病毒治疗一个疗程以上的，耐药突变点变异为M204V/I型的13例，L180M型的为5例，L180M+M204VI的为5例，未检出其他突变基因型。23例耐药基因型中HBV-C基因型占20例，3例为HBV-B基因型。结论本地区HBV基因型以C型为主，核苷（酸）类药物抗病毒治疗过程中HBV-C基因型容易发生基因突变而耐药，且以M204V/I突变型为主。检测HBV基因型和耐药突变型是指导临床抗病毒治疗的重要指标。

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简介：摘要新型冠状病毒肺炎疫情正成为全球关注的焦点。作为一种新发现的病毒，新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的来源、是否变异、感染途径等问题尚待研究。此文通过对GISAID平台发布中的SARS-CoV-2核苷酸序列进行分析，并就目前关于SARS-CoV-2的病毒起源、核酸序列、遗传关系、传播途径和感染机制等分子生物学方面的研究结合笔者对基因组序列分析进行了综述。

简介：摘要在HBV感染的过程发生的基因变异，主要分布在L链的开放读码区，变异株的产生影响着HBV抗原的表达、逃避疫苗免疫、引起耐药、改变病理过程等，故应引起临床诊断、治疗、预防、预后等方面的足够重视。

简介：摘要冠状病毒基因组资源库(Coronavirus Tracing，CoVTrac)是通过2019新型冠状病毒信息库(2019 novel coronavirus resource, 2019nCoVR)、全球流行性感冒病毒数据库(Global Initiative on Sharing All Influenza Data, GISAID)和美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information，NCBI)等多个数据平台及自测方式收集冠状病毒基因组序列(包括2019新型冠状病毒)，利用Java、Spring、Angular和MySQL等技术搭建的在线数据平台。CoVTrac数据库整合了包含α、β、γ、δ 4个冠状病毒属共456条基因组序列，实现了数据提交、数据展示、进化溯源分析、基因功能注释和辅助分子实验设计等功能。CoVTrac数据平台可为包括新型冠状病毒在内的冠状病毒基因组的科学研究、流行病学调查和快速检测、药物研发等行业应用提供支持。

简介：随着核苷（酸）类似物广泛、长期应用，HBV在抗病毒药物选择压力下导致耐药基因突变的问题亦日益凸显。本文重点介绍了核苷（酸）类似物在抗HBV治疗过程中病毒耐药的产生机制、耐药率及耐药检测的方法。

简介：摘要目的通过对74例丙型肝炎病毒（HCV）基因分型实验室检测结果并结合临床资料进行分析，探讨HCV基因分型的临床应用价值。方法收集我院住院患者抗-HCV和丙型肝炎病毒RNA核酸定量均为阳性的标本，采用丙型肝炎基因分型特异性引物及荧光探针，应用一步法聚合酶链式反应（RT-PCR）结合Taqman技术对HCV进行Ⅰ型和非Ⅰ型的荧光PCR分型检测。结果检测74例标本共检出两种基因型，分别为Ⅰ型基因30例，非Ⅰ型基因44例；74例感染者有输血者40例。结论74例感染者各基因型男女感染的比例差异无统计学意义，通过输血感染丙型肝炎病毒无性别差异。综合分析，HCV基因分型对丙型肝炎的预防、诊断、治疗、个体化用药以及愈后评估都具有重要意义。

简介：1丙型肝炎病毒(HCV)的基因结构HCV-1型病毒是单股正链RNA病毒,含有大约9400个核苷酸,在3'末端有一个"多肽A尾巴",核酸序列包含有由341个硷基组成的5'非翻译区,一个含3011个氨基酸的多肽蛋白的巨大的开放读码框架(Openreadingframe,ORF)和由约27个硷基组成的3'非翻译区.据推测,三种N-末端HCV蛋白(C.E1和E2/NS2)是结构蛋白,而四种C-末端蛋白(NS2,NS3,NS4和NS5)在病毒复制中起作用.每种HCV基因型的开放读码框架(ORF)的长度存在着特异性的差别,HCV-1型中ORF长度约9400个核苷酸,而HCV-2型中ORF长度是9099个核苷酸,HCV-3型长度是9063个核苷酸.

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简介：乙型肝炎由乙型肝炎病毒（HBV）感染引起,呈全球性分布,我国是乙型肝炎的高发病地区。目前根据HBV的进化变异程度可分为9种基因型,不同基因型的流行病学、自然史以及与抗病毒治疗效果间的关系均有其特征性,HBV基因分型有重要的临床意义。因此,HBV基因型的研究已成为近年来国内外研究HBV的热点问题。

简介：摘要目的了解新疆地区丙型肝炎病毒（HCV）基因型分布特征。方法选取2013年1月至2018年9月在新疆医科大学第一附属医院就诊的慢性HCV感染者6 462例，排除了重复检测者，有效纳入了检测HCV基因型者共4 773例，采用PCR-反向点杂交法，并回顾性分析基因型的分布。组间比较采用χ2检验或F检验，P < 0.05为差异有统计学意义。结果4 773例标本中检测出了5种基因型：1b型2 928例（占61.3%）、2a型1 241例（占26%）、3a型375例（占7.9%）、3b型205例（占4.3%），6a型24例（占0.5%）。患者年龄在（48.14±13.93）岁，各年龄段均以检出基因1b型为主；汉族2 965例，18个少数民族共1 808例，其中汉族和少数民族基因1b型分别为1 798例（占60.6%）、1 130例（占62.5%），基因3型分别为235例（占7.9%）、345例（占19.1%）。在少数民族中主要以维吾尔族居多，且可检测出基因6a型，其他民族未检测出6a型，检出基因1b型维吾尔族704例（占62.1%），基因3型维吾尔族共269例（占23.7%）。男性2 413例，女性2 360例，其中基因1b型男性1 418例（占58.8%）、女性1 510例（占64.0%）；基因3型男性424例（占17.6%），女性156例（占6.6%）。基因1b型与基因非1b型患者性别比例比较，差异有统计学意义（P < 0.05）；汉族与少数民族患者基因型2a、3a、3b、6a型的检出率比较，差异均有统计学意义（P值均< 0.05)。结论新疆地区HCV基因型分布呈多样性，以1b型为主。少数民族HCV基因3型较汉族比例高。新疆HCV基因型检测丰富了我国HCV基因型分布特征，并为患者个体化治疗提供依据。

简介：[摘要]目的：探讨肝炎病毒基因型与抗病毒治疗反应的关系，为个体化治疗提供依据。方法：根据HBV基因型分为A型、B型、C型和D型四组，每组33例。比较各组患者的一般资料、肝功能、HBV DNA水平、HBeAg血清转换率和HBsAg清除率。结果：A型组的HBeAg血清转换率和HBsAg清除率均显著高于其他三组（P<0.05），而C型组的这两项指标均显著低于其他三组（P<0.05）。结论：HBV基因型与CHB患者的抗病毒治疗反应有密切关系，A型患者的治疗反应最佳，C型患者的治疗反应最差，B型和D型患者的治疗反应相似。HBV基因型检测有助于指导CHB患者的个体化治疗。

简介：<正>全世界乙型肝炎病毒（HBV）表面抗原（HBsAg）携带者高达2亿,已成为最严重的社会问题之一。近年来的分子生物学技术对HBV基因结构及表达产物、与宿主细胞DNA整合的研究取得了长足进展,并将积极促进对HBV感染的防治。完整的、直径42nm的HBV（Dane颗粒）可分为外衣壳和核衣壳两部分:前者由外衣壳蛋白（HBsAg前S1蛋白、前S2蛋白）、多糖及类脂组成;后者由核心抗原HBcAg,e

简介：为了探明烟草脉带花叶病毒危害和流行的机制,使用RT-PCR技术扩增获得TVBMV云南分离物YN9.1基因组全序列,并进行了基因组结构、序列同源性、氨基酸保守基序、系统进化和重组分析。结果表明：（1）YN9.1基因组具有Potyvirus属病毒典型特征,含有在Potyvirus属病毒中较为少见的NIb/CP切割位点Q/N;（2）YN9.1与其它分离物核苷酸序列同源性为90.5-91.1%,氨基酸序列同源性为95.2-96.2%。与YND核苷酸和氨基酸序列同源性最高;（3）对HC-Pro和CP保守基序进行了分析。YN9.1具有RITC、PTK、DAG等病毒蚜虫传播保守基序,其中RITC在Potyvirus属病毒中常见形式为KITC;（4）系统进化树分析结果显示,TVBMV进化形成2个组,云南分离物独立进化形成一组,TVBMV进化与地域具有明显的相关性;（5）重组分析发现PY为ZC1和YN的组内重组体,重组位点位于HC-Pro3’末端和NIb5’端。

简介：