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  • 简介:摘要:关键蛋白是这样的蛋白:如果被删除,就会导致细胞死亡或不育。关键蛋白的识别对于理解维持生命的基本要求是非常重要的。此外,对关键蛋白的全面分析有助于深入理解基因突变与人类疾病之间的关系,从而揭示人类疾病的一般规律。实验方法预测关键蛋白不仅价格不菲,而且很耗时。已经提出了多种基于蛋白相互作用网络识别关键蛋白的计算方法。本文概述了关键蛋白的研究现状,并进行了展望。首先分类介绍了现有的关键蛋白识别方法,然后介绍了与关键蛋白识别有关的数据集。最后,对关键蛋白识别面临的挑战和未来研究进行了展望。

  • 标签: 蛋白质相互作用 关键蛋白质 中心性 基因表达
  • 简介:生物系统具有鲁棒抵御外界干扰而维持自身性能稳定的特征。细胞中分子相互作用负反馈环是系统鲁捧控制的主要机理之一。本文对各种负反馈环之间的差异进行了对比并针对p53、Mdm2构成的负反馈环建立了数学模型,以模拟负反馈系统的衰减振荡。

  • 标签: 蛋白质相互作用网络 负反馈环 鲁棒性 数学模型
  • 简介:研究植物单宁-蛋白相互作用在制革、医药等方面具有很重要的意义,而计算机模拟技术和理论在相关的研究中得到广泛的应用.本文综述了单宁-蛋白反应的机理和分子模拟及理论计算中常用的方法,并展望了其应用前景.

  • 标签: 植物单宁 蛋白质 计算机模拟 相互作用 制革 皮革
  • 简介:摘要目的建立燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个微小RNA(microRNA,miRNA)靶基因的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选具有重要作用的基因及基因模块。方法将本课题组前期筛选的燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个miRNA(hsa-miRNA-3131、hsa-miRNA-4516、hsa-miRNA-6501-5p、hsa-miRNA-10b-5p、hsa-miRNA-4683)的靶基因定位到STRING在线数据库(https://string-db.org),筛选PPI网络。使用Cytoscape v3.6.0软件对PPI网络可视化,通过NetworkAnalyzer插件得到拓扑属性值度和拓扑属性值介数,筛选PPI网络的中心节点(度和介数均最高的节点)。同时,采用CytoHubba插件中的最大团中心(MCC)分析方法来确定PPI网络中的重要节点。通过MCODE插件进行聚类分析,筛选PPI网络的基因模块。将基因模块所包含的蛋白名称在线提交KOBAS v3.0数据库(http://kobas.cbi.pku.edu.cn/),对MCODE插件筛选出的基因模块进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析。结果靶基因的PPI网络由1 035个节点和4 346个边组成。泛素蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)的度(101)和介数(0.010 723 89)均最高,为PPI网络的中心节点。经MCC分析,UBA52为PPI网络中的重要节点。从PPI网络中选择排名前5的基因模块,5个基因模块的KEGG通路富集分析中高度富集的基因通路分别为泛素介导的蛋白水解、剪接体、内吞作用、神经活性配体-受体相互作用、囊泡转运。结论成功建立了燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达的5个miRNA靶基因的PPI网络,筛选出UBA52基因和5个基因模块主要通路。

  • 标签: 微小RNA 蛋白质-蛋白质相互作用网络 KEGG
  • 简介:摘要:本研究基于共聚焦荧光共振能量转移(RET)技术,深入探讨了蛋白相互作用的分子机制,并在此基础上开展了生物检测应用的探索。通过构建荧光标记的蛋白模型,我们详细分析了RET技术在研究蛋白相互作用中的优势和应用潜力。实验结果表明,RET技术不仅能够高效、灵敏地监测蛋白相互作用,而且在生物检测领域具有广泛的应用前景。

  • 标签: 共聚焦 荧光共振 能量转移 相互作用
  • 简介:摘要目的探究人体中与结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)Rv1705c蛋白相互作用蛋白。方法原核表达Rv1705c蛋白基因,收集包涵体,裂解后透析纯化Rv1705c并测定其浓度,ELISA法检测细菌Rv1705c刺激巨噬细胞后细胞因子IFN-γ的分泌量,使用纯化并带有生物素标记的Rv1705c孵育人蛋白组芯片HuProt™,筛选与Rv1705c相互作用的人类蛋白,使用GenePix Pro 6.0软件对蛋白芯片的信号图像进行数据提取,使用GO、KEGG等多个数据库进行生物信息学分析,GST pulldown验证Rv1705c与PSMA3、RSAD2的相互作用。结果纯化结果显示,Rv1705c在包涵体中表达,Rv1705c刺激巨噬细胞后IFN-γ分泌量显著上升。芯片结果显示共筛选出了29个与Rv1705c相互作用的潜在阳性蛋白,其中PSMA3、NLN、THOP1、UPF3A、RSAD2、OMG、PNKD、STEAP3、MED8共9个蛋白的信噪比(signal-to-noise ratio,SNR)>1.6。进一步的生物信息学分析发现候选蛋白PSMA3、RSAD2、C1QBP参与固有免疫应答激活信号转导,并且PSMA3、RSAD2与干扰素存在交互作用,GST pulldown验证PSMA3、RSAD2与Rv1705c确有相互作用。结论发现并验证PSMA3、RSAD2与Rv1705c存在相互作用,为Mtb感染机制的研究提供参考。

  • 标签: 人蛋白质组芯片 Rv1705c 生物信息学 结核病
  • 简介:本文介绍了一种以硅胶为基质,修饰多功能氨基官能团的疏水相互作用色谱固定相。由于同时具有疏水和亲水配基,这种固定相在水相中的稳定性得到了改善。这种修饰还能改善蛋白/多肽分离的分辨率和柱效,同时延长色谱柱的使用寿命。

  • 标签: 疏水相互作用 蛋白质组学 高稳定性 色谱柱 分离 色谱固定相
  • 简介:生命中无时无刻不存在生物大分子之间的相互作用,其中包括核酸之间、核酸与蛋白之间以及蛋白之间的相互作用。以往研究蛋白之间的相互作用通常采用生化技术,如偶联、免疫共沉淀等方法。1989年,Fields和Song创立了一种崭新的遗传学方法用于研究蛋白之间的相互作用,即酵母双杂交系统(Yeast

  • 标签: 酵母双杂交系统 蛋白质相互作用 报告基因 转录激活 杂交蛋白 细胞周期
  • 简介:

  • 标签:
  • 简介:为考察模型在生物上的可靠性,从真实的蛋白相互作用研究所报道的数据出发,选取合适的复制-变异的关键参数,依据复制-变异的建模思想,构建了酵母蛋白相互作用网络模型。实证结果与目前得到认同的酵母蛋白网络的稀疏性、无标度性和小世界性吻合。由此可知,复制-变异模型在蛋白相互作用网络的演化模拟中是个可靠的模型。

  • 标签: 酵母 复制 变异 蛋白质相互作用网络
  • 简介:摘要目的探讨脑脊液糖和蛋白的尿液分析仪测定和化学定量法的差异。方法用尿液分析仪和常规的化学定量法同时测定临床送检的65例脑脊液标本的糖和蛋白。结果尿液分析仪测定脑脊液糖和蛋白结果与常规化学定量法存在较大的差异。结论尿液分析仪的糖和蛋白试纸只能用于尿液的过筛性试验,不能代替临床脑脊液的常规分析,否则会造成临床误诊。

  • 标签: 测定 蛋白质 血清总蛋白(TP)
  • 简介:蛋白是一切生命的物质基础,是肌体细胞的重要组成部分,也是人体组织更新和修补的主要原料。没有蛋白就没有生命。人体内蛋白时时刻刻都处于“动态平衡”之中,机体消耗的蛋白全部由食物补充。食物中的蛋白经过消化、分解成氨基酸后,才能被吸收进入血液、肝脏中,再经一系列复杂的生化反应,最终合成人体所需的各种蛋白

  • 标签: 蛋白质 物质基础 人体组织 生化反应 体细胞 氨基酸
  • 简介:

  • 标签:
  • 简介:摘要:蛋白是人类细胞中最主要的组成成分之一,而人类许多生命活动都离不开蛋白。目前已有的研究结果显示,人体所需的蛋白约占总能源的18%。蛋白是一类具有生物活性的大分子。目前,乳制品中的蛋白的含量是衡量乳制品品质的主要因素之一。针对这一现状,重点对乳制品中蛋白的常规测定以及蛋白含量的测定进行了分析。

  • 标签: 蛋白质 检测方法 乳制品 蛋白质含量测定
  • 简介:上期提到了供能营养素,蛋白是其中之一。“蛋白”一词来源于希腊文的proteios,意为“头等重要”。蛋白是构成机体组织、器官的重要成分,也是涮节生命活动的多种活性物质的重要成分,还是人体能量的来源之一。因而可以说:蛋白是生命的物质基础,没有蛋白就没有生命。

  • 标签: 生命活动 蛋白质 机体组织 活性物质 人体能量 物质基础
  • 简介:

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  • 简介:摘要有机大分子蛋白是生命物质基础,其基本组成单位是氨基酸,是构成细胞的基本有机物,是生命活动的主要承担者。它与生命以及各种生命活动紧密联系,几乎参与了全部生理过程。蛋白还是大多数食品的主要成分,是一类重要的产能营养素。蛋白的复杂结构决定了其功能的复杂性,鉴于此,要研究蛋白的具体功能及其应用的前提是解析出高分辨率的三维结构。

  • 标签: 蛋白质结晶 X射线衍射 晶体质量
  • 简介:我们知道,对蛋白在细胞中的特异定位,可以增进我们对该蛋白以及与该蛋白互作的其他蛋白功能的了解,确定蛋白位置的一个方法是。在其上加一特异抗体。即对其贴上标签,然后加入能同此抗体特异结合的探针,最后用显微镜确定此探针在细胞中的位置。

  • 标签: 亚细胞定位 蛋白质 特异抗体 特异结合 显微镜 位置