简介：早在70年代,Anfinsen就提出蛋白质分子的一级序列决定其空间结构的论断,这一论断得到多次实验证实并被人们广泛接受,成为蛋白质结构预测的理论基础。由于蛋白质分子的结晶非常困难,因此蛋白质三维结构预测成为目前了解蛋白质结构信息的重要手段,这一研究领域也成为蛋白质工程研究的一个非常活跃的方向。

简介：2007年底，Burrill公司对2008年美国生物技术产业做了预测。作为投资者消化年末收益和第一季度的结果，尤其是整个美国市场对次级贷款危机及其对经济影响的担忧，2008年的上半年，美国的资本市场仍将是动荡的。但在这一年里，生物技术优秀企业将继续获得令人难忘的金融收益，而中型和小型的生物技术公司也将紧随其后。到2008年末，

简介：为了研究提高血红蛋白粘聚体的稳定性，利用计算机同源模建、分子间氢键形成及表观静电势理论，探讨血红蛋白及相应突变体的结构与功能与功能关系。分析发现两个α９９位的Ｌｙｓ突变为Ｃｙｓ后，它们之间可以形成二硫键，两个β８２位的Ｌｙｓ突变为Ｃｙｓ可以增强形成分了间氢键的能力，分别起到稳定四聚体的作用。分析表明，突变体血红蛋白将具有更高的稳定性，从而提高血红蛋白稳定性及借助计算机工具设计新型奕变体提供参考。

简介：目的：对目前研究较为广泛的miR-15a的靶基因进行预测及相关生物信息学分析，以期为miR-15a靶基因的实验验证提供数据支持，并为深入研究miR-15a的调控机制及生物学功能奠定基础和提供理论指导。方法：选择TargetScan5．1与PicTar两种计算方法预测miR-15a的靶基因的交集作为分析的基因集合，分别进行GO注释描述、GO富集分析和生物通路富集分析。结果与结论：预测靶基因集合分别富集在转录调控、蛋白质修饰、细胞周期等生物学过程和蛋白激酶活性等分子功能上（P〈0．01）；经典miR-15a预测靶基因集合显著富集于KEGG通路数据库中的Wnt信号通路、细胞周期和p53信号通路等5个信号转导通路及前列腺癌、慢性髓细胞性白血病、黑素瘤等7个疾病通路中（P〈0．05）。

简介：目的：用生物信息学方法对沙丘芦苇胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖脱水酶（PcTGD）的序列进行分析与结构预测，为后续研究提供参考。方法：以GOR法预测了PcTGD的二级结构，以ProtScale分析它的疏水性，最终通过现有的序列同源性比较，用MODELLER预测了PcTGD的三维结构。结果：PcTGD具有高度保守的活性中心Tyr＊＊＊Lys和N末端的Gly＊Gly＊＊Gly的高度保守结构。结论：PcTGD属于一个短链脱氢酶／还原酶家族。

简介：目的：人肌球蛋白7A（MYO7A）基因是遗传性耳聋分子筛查的候选基因之一。从已知的MYO7A非同义单核苷酸多态性（nsSNPs）位点数据库中筛选可能与致病表型相关的nsSNPs位点,以提高MYO7A基因耳聋分子诊断的有效性和准确率。方法：首先,从NCBI数据中心的dbSNP数据库（dbSNP）和DeafnessVariationDatabase数据库获得MYO7A基因的SNPs数据和基因的相关信息;然后,通过SIFT、PolyPhen-2、PANTHER、PhD-SNP、MutationTaster、SNP＆GO和MutPred软件进行nsSNPs表型致病性分析,预测潜在致病位点;接着,应用ClustalX2和GeneDoc软件进行同源氨基酸序列比对,分析潜在致病的nsSNPs位点保守性;最后,应用SwissModel平台选择性地对某些突变蛋白质的三维结构进行建模,并分析结构域的变化。结果：预测出MYO7A的104个高风险致病的nsSNPs位点,包括25个已报道的耳聋相关nsSNPs位点;高风险致病的nsSNPs位点中,有42个位于肌球蛋白马达（myosinmotor）结构域,其中12个预测有致病风险的nsSNPs位点与MYO7A基因致聋的突变研究报道一致。肌球蛋白马达结构域中包含30个新预测的潜在致病性nsSNPs位点,其中仅L366P位点在7个预测软件中具有高度一致性。通过对L366P位点位点突变前后的三维模型构建,发现存在蛋白结构的改变,且同源性比对结果显示了该位点的高度保守性。结论：MYO7A的L366P为潜在高风险致病性nsSNP位点,推测该基因突变可能与耳聋表型相关。本研究所采用的分析筛选方法对MYO7A基因突变的临床筛查及其他致病基因的nsSNPs筛选具有重要的参考价值。