通过对湖南农户自留种原地保存（简称农户保存）与异地低温保存在湖南种质库（简称种质库保存）的92份同近名水稻材料（7组，同近名材料6组）间的表现型及基因型进行分析，鉴定同近名品种间遗传距离，为之后有效保存、针对性供种、高效利用提供理论依据。结果表明．供试同近名材料间，及农户保存与种质库保存的同近名材料间在表现型性状上都有极显著差异。通过SSR标记基因型比较农户保存与种质库保存湖南同近名材料，发现除E组外，其他组都是农户保存的等位基因变异数小于种质库保存的等位基因变异数，说明农户保存的材料在年复一年的种植、收种过程中经历了自然选择和人工选择留种，进行了加代纯化。除C、E组外。在同近名组内SSR标记遗传相似系数显示，农户保存的材料间〉种质库保存的材料间〉农户保存材料与种质库保存材料。表明农户自留种保存的同近名水稻资源值得收集评价。
