STR基因座多步突变的亲子鉴定1例

(整期优先)网络出版时间:2020-10-23
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STR基因座多步突变的亲子鉴定 1例

林一平

(福建科胜司法鉴定所 福建 莆田 351100)

关键词:法医遗传学;亲子鉴定;多步突变;STR

1案例

1.1案情

因户口申报需要,一男子(假设父)携带一自称为其女儿的孩子来本鉴定所要求进行亲子鉴定。本鉴定所采集两位被鉴定人指尖血备检。

1.2检验过程

采用MicroreaderTM 21 Direct ID System(苏州阅微基因技术有限公司)进行复合扩增,发现D12S391基因座不符合孟德尔遗传规律,随后采用PowerPlex21 System试剂盒(Promega公司)对20个STR基因座进行了检验。同时采用MicroreaderTM 23sp-D ID System试剂盒(苏州阅微基因技术有限公司)对常染色体STR基因座加测到39个位点,Goldeneye17X(基点认知技术有限公司)对X染色体上17个STR基因座进行复核扩增,又发现D21S1270基因座不符合孟德尔遗传规律。

1.3检验结果

在D12S391基因座,假设父的基因型为“17”,孩子的基因型为“20”,存在多步突变的可能。在D21S1270基因座假设父的基因型为“11,14”,孩子的基因型为“10,12”,为较常见的一步突变。39个常染色体STR基因座的累计亲权指数CPI为2.1249×1011(注:大于10000),亲子关系相对机会RCP大于99.99%。常染色体STR基因座分型结果如(表1)显示。

表1 常染色体STR基因座分型结果

STR基因座

假设父

孩子

亲权指数PI

D19S433

13.2

,

14.2

13

,

13.2

6.7204

D5S818

11

,

13

11

,

13

2.5352

D21S11

29

,

30

30

,

31.2

0.8948

D18S51

16

,

18

18

,

18

10.9890

D6S1043

11

,

18

11

,

11

4.5704

D3S1358

17

,

17

16

,

17

2.4248

D13S317

9

,

11

11

,

11

2.1115

D7S820

9

,

12

8

,

12

1.0192

D16S539

11

,

12

12

,

12

2.4295

CSF1PO

11

,

12

11

,

12

1.6819

PentaD

9

,

11

10

,

11

2.0292

D2S441

10

,

11

10

,

14

0.9984

vWA

14

,

14

14

,

16

1.9478

D8S1179

13

,

15

13

,

13

2.2512

TPOX

8

,

11

11

,

11

1.6739

PentaE

12

,

13

12

,

13

5.8332

TH01

7

,

7

7

,

8

1.8769

D12S391

17

,

17

20

,

20

0.0001

D2S1338

18

,

25

18

,

25

7.8962

FGA

22

,

23

23

,

23

2.2351

D6S477

15

,

16

15

,

15

1.6529

D18S535

10

,

14

10

,

10

11.9332

D19S253

11

,

12

12

,

12

1.5101

D15S659

15

,

15

11

,

15

2.8377

D11S2368

18

,

23

17

,

23

5.7737

D20S470

17

,

19

14

,

19

30.1205

D1S1656

14

,

15

14

,

16

3.1807

D22-GATA198B05

17

,

17

17

,

21

3.2113

D7S3048

22

,

24

20

,

24

1.5985

D8S1132

16

,

21

16

,

22

17.8571

D4S2366

10

,

11

10

,

10

9.3110

D21S1270

11

,

14

10

,

12

0.0068

D13S325

19

,

21

19

,

19

1.9623

D9S925

14

,

14

14

,

17

3.6684

D3S3045

9

,

13

9

,

13

1.8702

D14S608

6

,

12

12

,

12

4.4209

D10S1435

11

,

13

8

,

13

1.0478

D17S1290

10

,

22

10

,

16

6.0827

D5S2500

11

,

16

11

,

12

0.8432

对本案假设父和孩子X染色体上17个STR基因座进行复核扩增,X-STR基因座分型结果数据显出:孩子在17个X-STR基因座中的每个基因座都有一个等位基因与假设父相同。由于X染色体特有的遗传方式: 男性的X染色体只有一条,只能遗传给女儿。所以父女的亲权鉴定用 X-STR 比常染色体 STR 更有效1 。故这一案例在39个常染色体基因座基础上增加检测 X-STR 基因座。

1.4鉴定结论

在排除同卵多胞胎、近亲及外源干扰的前提下,支持假设父为孩子的生物学父亲。

2讨论

STR目前在亲子鉴定中被广泛应用。STR的高突变率使得亲生父(母)与孩子之间会出现不符合遗传规律的情况。[2]据李秋阳[3]调查统计,父源性突变率远高于母源性。在实践中,亲子鉴定STR发生突变的现象是普遍存在的,STR 突变是逐步突变的,即每次突变只改变一个重复单位,两个或更多个重复单位的变化是在前一次突变基础上发生的,也就是多步突变是逐步形成的。最终突变都表现为增加或减少一个或几个重复单位。90% 以上的 STR 突变均为增加或减少一个重复单位,即一步突变。二步突变者少于10% ,更多步突变的比例更少[4]。本案例中这对父女出现2个STR基因座突变,且一个是三步突变。查阅文献发现,亲子鉴定中同时存在 2 个STR基因座且有三步以上突变的只有报道过一例[5]

经询问该男子的妻子失联13年多,男子的直系男性亲属只有一个父亲,因怀疑该孩子是否有可能与男子的直系男性亲属存在亲生血缘关系,经本所鉴定人采该男子的父亲(孩子的爷爷)指尖血备验。 发现20个STR基因座该男子的父亲与孩子有6个基因座不符合孟德尔遗传规律,累积亲权指数CPI小于0.0001,RCP小于0.01%。排除该男子的父亲为孩子的生物学父亲。

本案例采用常规亲子鉴定案件使用的20个STR基因座复核扩增体系进行检测时,发现D12S391基因座违反孟德尔遗传规律,增加检测19个STR基因座的分型,发现D21S1270基因座违反孟德尔遗传规律,检测假设父和孩子X-STR基因座,孩子的每个X-STR基因座上的等位基因都有一个与假设父相同。计算常染色体的CPI和RCP,已超过亲权认定的标准。在日常实践中,如果遇到多步突变的应换一种检测试剂盒验证分型是否正确,遇到可疑的需要检验性染色 STR 来辅助。对于发生于父亲和儿子之间的突变可以用 Y-STR 来验证,而对于某些父亲与女儿或母亲与孩子的鉴定可依靠检测X-STR或二代测序来完成。本案采用检测16个X-STR基因座,可为解决突变案例提供辅助手段。二联体亲子鉴定遇到2-3个STR突变的可以考虑直系亲属做排除验证。在本案中假设父的父亲是假设父唯一的男性直系亲属,经常染色体20个STR基因座检测结果与孩子为排除关系。提高鉴定结果的准确性。


参考文献:

[1] Szibor R. X-chromosomal markers: Past,present and future[J]. Forensic Sci Int( Genet) ,2007,1( 2) : 93-99.

[2] Brinkmann B , Klintschar M , Neuhuber F , et al. Mu-tation rate in human microsatellites : influence of the structure and length of the tandem repeat [J]. Am J Hum Genet , 1998 , 62 ( 6 ): 1408-1415.

[3]李秋阳,丰伟军,杨庆恩,等。常用STR基因座突变的观察与分析[J]。法医学杂志,2005,21(2):86-89

[4] 吕德坚,陆惠玲 . 亲子鉴定 STR 突变的考虑 [J]. 中国司法鉴定, 2009 , 45 ( 4 ): 43-45.

[5]张陈明,陶 胜. 亲子鉴定中 STR 基因座可疑多步突变 2 例 [J]. 法医学杂志,2017,33(4):451-452