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  • 简介:本文提出DNA序列相似指标,建立DNA序列比对算法。首先,将水生生物DNA样本序列与现有的基因库中的DNA序列逐项比对;其次,在满足特定阈值条件下,确认样本序列的分类。利用Java编程语言来实现算法,通过MonteCarlo模拟和实际应用,验证算法的有效性。理论结果表明:在满足特定阈值条件下,通过计算DNA序列相似,能够确定数据库中与未知DNA样本序列相似序列,判断样本序列的分类。模拟实验、对比研究和应用结果表明:相似指标算法在有效判别DNA序列的分类,提高DNA序列匹配成功率,降低程序复杂等方面具有优良特征。

  • 标签: DNA序列相似度指标 水生生物 MONTECARLO模拟
  • 简介:时间序列相似性查询从提出到现在已有10多年的历史,取得了大量的研究成果。索引既是时间序列相似性查询实现的关键,也是信息技术领域的热点问题之一。近年来,国内外学者为进一步提高查询的完备而对时间序列索引方法进行了深入的研究。本文在阐述时间序列查询原理的基础上,对各种索引方法进行了阐述和比较,以期对时间序列分析的研究和应用有所启发和帮助。

  • 标签: 时间序列 相似性查询 索引
  • 简介:据中国农科院最新消息,该院蔬菜花卉研究所蔬菜功能基因组学创新团队与国内外同行合作,发现了一个大片段DNA序列拷贝数变化可以决定黄瓜的性别。相关成果发表于最新一期国际著名学术期刊《植物细胞》。团队首席、中国农科院蔬菜花卉所研究员、深圳农业基因组所副所长黄三文介绍,大片段DNA序列的结构变异(StructuralVariation,简称SV)包括插入/缺失、拷贝数变化和倒位等多种类型,可引起许多人类疾病(如自闭症和精神分裂症)的发生;

  • 标签: DNA序列 拷贝数 中国农科院蔬菜花卉所 性别 黄瓜 蔬菜花卉研究所
  • 简介:用代数的方法证明了有关图序列的几个不等式,并且得到了其相应的极图。

  • 标签: 度序列 极图 谱半径
  • 简介:n为非负整数序列,若存在以该序列序列的图,则称n为可图的,特别的,若此图是一个定向图,该序列则称为是定向可图的,本文提出了一个判断序列是否为定向可图的充分必要条件,并且在定理的证明过程中给出了一个在定理条件下构造所求定向图的有效算法。

  • 标签: 定向可图 度(偶)序列 定向图
  • 简介:  本方法计算的黄芪药材指纹图谱相似准确,黄芪指纹图谱相似,对照指纹图谱数据对标准指纹图谱数据进行计算

  • 标签: 图谱相似 指纹图谱 相似分析
  • 简介:阿根廷科学家近日成功将该国国歌旋律以人工基因编码形式植入某种细菌染色体中。这一方法不仅可以用来存储音乐旋律,还可能发展为一种拥有巨大应用潜力的信息存储方式。

  • 标签: 存储器 科学家 DNA序列 信息 细菌 音乐旋律
  • 简介:高通量测序技术的飞速发展让生物信息领域迎来了大数据时代。新技术在提供海量生物遗传信息的同时,也给分析这些数据带来了新的挑战。DNA序列比对是信息分析流程中的关键步骤,为后续的变异检测提供序列比对信息。2015"深圳杯"数学建模夏令营B题以DNA序列比对为研究课题,希望参赛学生给出序列快速比对的最佳方案。本文简要点评了各参赛队伍的解答情况,然后介绍了现有DNA序列比对软件中用到的算法和数据结构。

  • 标签: 字符串匹配 DNA序列比对 哈希算法 字典树 后缀数组 BWT压缩
  • 简介:摘要目的探讨精子DNA损伤与精液常规检查指标的关系。方法回顾分析我院收治的120例男性不育患者的临床资料,并根据精子DNA损伤程度分为两组。结果DNA损伤率<25%组患者的前向运动精子、精子活动率、精子正常形态率等指标均显著优于DNA损伤率≥25%组,组间差异显著(P<0.05)。结论精子DNA损伤或可成为独立精子质量评价的重要指标,并有助于改善辅助生殖治疗结局。

  • 标签: 不育 男性 精子 DNA 损伤
  • 简介:根据灰色关联分析的基本思想,基于灰色斜率关联的计算模型,提出了一种新的灰色斜率相似关联计算模型,它满足相似性。该计算模型充分利用了序列在各个时点的信息和正、负相关性,得出的关联分析结果比较客观可靠。实例分析表明:该模型简单,且具有良好的应用性。

  • 标签: 灰色 灰色系统 灰色关联度 斜率关联度 相似性
  • 简介:本文主要分析汉语和泰语声调的相似,可分为两部分:(1)声学特征分析;(2)声调感知研究。声学特征分析是先总结出汉语和泰语声调的材料,然后再测量出两种语言的相似,主要在声调音高上进行考察。声调感知研究是通过泰语母语者汉语声调的感知来考察汉语和泰语声调的相似。然后将两者的结果进行讨论,目的是为了探讨泰语母语者如何基于两种语言声调的相似现象感知汉语声调。研究结果可以给泰国学习者汉语声调教学提供可靠性的依据。

  • 标签: 汉语声调 泰语声调 相似度 声学特征 感知
  • 简介:摘要:单词是记忆所需要的最基础单元;单词信息抽取[1]技术核心在于计算单词的语义相似,在计算单词语义相似的方法中,基于结构化知识库和基于非结构化语料库的方法是目前比较主流的方法。除此之外,一些研究利用单词自身的词缀、分布等内部特征信息来进行辅助计算语义相似,是进一步提升相似准确率的有效举措。

  • 标签: 单词抽取 单词记忆 语义相似度 人工智能与机器学习
  • 简介:摘要:在白酒酿造的过程中,浓香型白酒是非常重要的一个品种。浓香型白酒分为三大流派,目前通过感官品评无法准确的对不同流派浓香型白酒进行分类,且受评价者的主观影响,导致评价结果难以量化。本文就浓香型白酒相似的评价方法进行研究,为浓香型白酒的分类提供数据支持。

  • 标签: 浓香型 白酒 相似度 评价 鉴别
  • 简介:目的获得东方田鼠的特异DNA序列.方法Aβ基因使用PCR,基因克隆,斑点杂交,DNA序列分析,生物信息学技术.结果根据小鼠MHCⅡ外显子2及其两侧序列,合成引物并扩增东方田鼠基因组DNA,将PCR产物回收、测序后,分别设计内引物扩增东方田鼠基因组DNA,其中一对引物可得到特异性扩增带,将得到的DNA片段插入PGEM-Teasy载体,进行序列分析.用这对引物扩增人、昆明小鼠、BALB/c小鼠及C57BL/6J小鼠基因组DNA,均无扩增产物.以东方田鼠特异性扩增产物为探针进行斑点杂交,除东方田鼠基因组DNA外,其他几种动物基因组DNA均为阴性结果.进一步对该DNA片段进行了BLAST同源性搜索和外显子预测,在Genbank中没有发现高度同源序列,并且找到一个可能的外显子,该外显子由69个氨基酸组成.结论获得的DNA片段为东方田鼠的特异片段,这将为从分子水平深入研究东方田鼠的遗传背景、生物进化规律以及东方田鼠抗日本血吸虫的机理奠定基础.

  • 标签: 东方田鼠 扩增 外显子 DNA片段 斑点杂交 引物
  • 简介:利用共有峰率和变异峰率双指标,以番薯属六种样品的红外光谱为依据,计算出所测样品的共有峰率和变异峰率,建立番薯属六种样品的共有峰率和变异峰率双指标序列,揭示了番薯属六种样品之间的关系.结果表明紫薯果皮与紫薯果肉,白薯果皮与白薯果肉,红薯果皮与红薯果肉共有峰率分别为66.7%、37.5%、44.4%;三种番薯的果肉与果皮差距较大.通过比较三种果肉与三种果皮,可以发现它们的共有峰率在50%左右,这说明同属三种番薯的组成成分较为相近.该方法能从整体水平分析出番薯属的成分,具有速度快、重现性好、操作简单、破坏性小、样品量少等优点,从而为解决番薯属内在差异和植物同属鉴别提供了一种新的方法.

  • 标签: 傅里叶变换红外光谱 番薯 共有峰率 变异峰率 双指标分析法
  • 简介:本体概念语义相似计算被广泛应用于本体映射、语义web服务本体匹配等领域,以往的概念语义相似计算方式存在计算粒度大,计算方法单一等缺陷。文中提出一种改进的基于概念子图的概念语义相似计算方法,该方法考虑了本体概念的深度、密度对语义距离的影响,细化了计算粒度,并将语义距离与信息量方法相结合。试验表明,改进的方法优于传统方法。

  • 标签: 本体 本体概念语义相似度 信息量 语义距离 概念子图
  • 简介:提出了一种基于用户兴趣及标签相似的混合推荐算法,构建基于标签的用户兴趣模型,通过计算与资源相似完成推荐,同时融合时间因素研究用户兴趣变化,提高了基于内容的推荐中相似计算的准确率;根据用户兴趣相似聚类用户,通过兴趣协同推荐减少对评分矩阵的依赖,一定程度上解决了协同过滤中推荐数据缺失问题;同时,结合用户基本信息有望缓解冷启动问题。实验表明该算法具有一定的有效性及可行性。

  • 标签: 用户兴趣 标签 相似度 混合推荐