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96 个结果
  • 简介:本文提出DNA序列相似度指标,建立DNA序列比对算法。首先,将水生生物DNA样本序列与现有的基因库中的DNA序列逐项比对;其次,在满足特定阈值条件下,确认样本序列的分类。利用Java编程语言来实现算法,通过MonteCarlo模拟和实际应用,验证算法的有效性。理论结果表明:在满足特定阈值条件下,通过计算DNA序列相似度,能够确定数据库中与未知DNA样本序列最相似的序列,判断样本序列的分类。模拟实验、对比研究和应用结果表明:相似度指标算法在有效判别DNA序列的分类,提高DNA序列匹配成功率,降低程序复杂度等方面具有优良特征。

  • 标签: DNA序列相似度指标 水生生物 MONTECARLO模拟
  • 简介:DNAisthegeneticmaterialofvariousorganisms.ExtracellularDNAadsorbedorboundonsurface-activeparticlesinsoilshasbeenshowntopersistforlongperiodsagainstnucleasesdegradationandstillretaintheabilitytotransformcompetentcells.ThispaperreviewssomerecentadvancesonthebindingandtransformationofextracellularDNAinsoils,whichisfundamentaltounderstandingthenatureofthesoil,regulatingbiodiversity,andassessingtheriskofreleasinggeneticallyengineeredmicroorganisms(GEMs)aswellasbeinghelpfulfordevelopmentofthegeneticevolutionaltheoryofbacteria.Severalinfluencingfactors,suchassoilpH,ionicstrength,soilsurfaceproperties,andcharacteristicsoftheDNApolymer,arediscussed.Todate,theunderstandingofthetypeofmolecularbindingsitesandtheconformationofadsorbedandboundDNAtosoilparticlesisstillinitsinfancy.

  • 标签: 土壤生态学 DNA 脱氧核糖核酸 基因材料 组织吸收
  • 简介:<正>一般来说,从一些特殊种类的植物中分离出即大又纯的DNA是比较困难的。因为植物细胞的成分随着发育时期、种类和组织的不同而改变,而且,植物细胞中还含有很多多糖酶。要想把重组个体的DNA技术应用于桑树,必须从适合的桑树器官,如叶子中找出分离DNA的方法。叶绿体DNA已能从桑叶中分离出来了(卡特基里等1984),但全DNA尚未能分离出来。本试验测定了一种从桑叶中分离出全DNA的方法。材料和方法:本试验采用摩雷和汤姆生(1980年)所提出的方法来从桑叶中分离出全

  • 标签: 桑叶 桑树 CSCI 植物细胞 卡特基 汤姆生
  • 简介:提取高质量的植物基因组DNA是顺利开展RAPD分析研究的一项重要基础工作,在目前比较广泛使用的植物基因组DNA的提取方法中,改进的Doyle和Doyle等人的CTAB植物基因组DNA提取法被证实为一种简单、高效的方法,值得推荐.更多还原

  • 标签: 提取 基因组DNA RAPD技术
  • 简介:家蚕由野桑蚕驯化而来,而野桑蚕sericin1及其上游调控序列的相关研究较少。本研究以家蚕sericin1及其上游调控序列设计引物克隆野桑蚕sericin1及其上游调控序列,将克隆得到的野桑蚕Sericin1序列翻译后用muscle软件与家蚕Sericin1蛋白序列比对,结果表明预测的野桑蚕Sericin1氨基酸序列与家蚕Sericin1A’(Ser1A’)氨基酸序列相似性很高,达98%。野桑蚕丝胶1基因上游调控序列与家蚕一样也存在多态性,克隆得到了106Ibp和636bp的两条序列,中间存在425bp的插入序列,与家蚕丝胶1基因上游调控序列相似性分别为98%和97%。

  • 标签: 野桑蚕 家蚕 丝胶1基因
  • 简介:应用DNA技术开展警犬优良品种保纯和培育,是提高我国警犬技术工作科技含量的重要举措,对于促进我国警犬技术与国际警犬技术接轨,通过警犬DNA数据库对警犬资源的遗传质量进行实时监测和管理,在保持我国警犬技术的可持续发展中将发挥重要作用.

  • 标签: DNA技术 警犬 应用 前景 DNA数据库 可持续发展
  • 简介:一个简单协议用变白的稻秧为脱氧核糖核酸抽取被建立,米饭脱氧核糖核酸由此直接在单个eppendorftube在0.5mol/LNaOH答案被提取。比较PCR分析和电气泳动的结果证明用这个方法提取的脱氧核糖核酸象那个使用的标准CTAB方法同样好、有用。

  • 标签: 水稻 聚合酶 分子标记 PCR分析 基因序列
  • 简介:本刊辑:据中国猪业网报道,西藏工布江达县“国家级藏猪遗传资源保护区”申请近日初步通过专家认证,这意味着藏猪DNA文库有望建立,这对藏猪遗传资源保护具有重要意义。

  • 标签: DNA文库 藏猪 西藏 遗传资源 资源保护区 中国猪
  • 简介:近年来,常有许多关于特种转基因鱼实验的报道(Zhu等,1985等)。由这些实验结果来看,转基因的整合频率略低于75%。但是,由于存在染色体外DNA,常使基因整合率的估计变得复杂而困难。

  • 标签: 虹鳟 外源DNA 卵子 转基因鱼 特种 基因整合
  • 简介:鉴于泛素与植物受高温等环境胁迫下产生的一些诱导型蛋白降解有关,本研究根据擎天凤梨Ostara早期花器的全长cDNA文库,经大规模随机测序及重叠群(contigs)内EST序列的拼接,获得了擎天凤梨多聚泛素基因全长cDNA序列(GenBank登录号:GQ890686),序列长1896bp,开放阅读框长1323bp,编码441个蛋白氨基酸残基,蛋白质分子质量为49.3kD,等电点pI为6.59。蛋白二级结构预测显示,该蛋白主要由随机卷曲、延伸链、α螺旋和β-转角组成;系统进化树分析表明与拟南芥推定的多聚泛素UBQ10(gi|23397122|gb|AAN31845.1|)亲缘关系最近;经推断它是由5个单体泛素组成的多聚泛素。本研究有助于进一步探讨该基因在低温胁迫下的反应机理以及如何采用分子调控手段增强擎天凤梨的耐低温能力。

  • 标签: 擎天凤梨 泛素 克隆 序列分析
  • 简介:西藏Shannan红鹿自然保护区是西藏的红鹿的地理分发的中心。这份报纸论述烘便的小团组在绿植物的时期期间在2013和2014期间收集了的199红鹿的DNA分析的结果。我们成功地与12microsatelliteloci从87个DNA小团组和坚定的单个鉴定提取了DNA。我们在R软件与Capwire评估了人口和各种各样的人口估计的基因差异。87个成功地提取的小团组来自50个个人。在人口,等位基因的平均数字是7.58吗??

  • 标签: 人口估计 基因差异 DNA 西藏 鹿 等位基因
  • 简介:采用植物血球凝素(PHA)体内注射、肾组织细胞短期培养、常规空气干燥法制备了虹鳟的染色体,并进行了核型分析。虹鳟二倍体的染色体为60条,其核型为22m+1st-7t,NF=104。以外周血红血球为样本,鸡红血细胞为对照,用美国产的FACStarplus流式细胞仪测定了虹鳟的二倍体细胞核的DNA含量,其DNA含量为鸡血对照的1.51倍,绝对含量为3.47±0.21Pg/N。

  • 标签: 虹鳟 核型 DNA含量 染色体数目 种质标准
  • 简介:遗传多样性亦称基因多样性,是指种内不同群体和个体间的遗传变异程度。遗传多样性是生物长期以来积累的宝贵财富,是生物多样性的重要组成部分,物种或群体因生态环境的改变和人类长期的选择,使存在的遗传突变得到积累,形成了丰富的遗传多样性。遗传多样性有四种表现层次,即体型外貌多态性、血液蛋白多态性、细胞水平多态性及DNA水平上的遗传多样性。DNA水平上的遗传多样性经历了限制性片段长度多态性(RFLP)、

  • 标签: 遗传多样性 DNA水平 血液蛋白多态性 限制性片段长度多态性 生物多样性 基因多样性
  • 简介:目前关于落叶木本果树DNA提取的材料多数为植物的叶片,叶片具有试材广泛、容易研磨、DNA产量高、质量好等优点,但也会受到季节、病虫害的影响且不耐贮藏。落叶果树枝条具有取材容易、DNA含量丰富的特点而适合在休眠季节用于提取DNA,进而加速果树分子生物学研究进程。本研究探讨了CTAB法、SDS法对休眠季节不同时期取材的葡萄、桃、樱桃、杏、苹果、银杏、柿子、枣8种落叶果树的一年生枝条DNA提取效果。结果表明:除葡萄外其他多数材料在整个休眠时期均能提出高质量的DNA,所提DNA电泳带纹清晰、亮度高,DNA产率高、质量优,可用于有关分子生物学的后续试验(RAPD分析);再DNA提取方法方面,从DNA产量和质量上来看,SDS法总体上要优于CTAB法。最后对提取中出现中存在过多的酚类、多糖和其他次生物质去除方法进行了讨论。

  • 标签: 落叶果树 韧皮部 DNA提取
  • 简介:本文通过两种方法提取红刺玫的基因组DNA,结果表明最适合的方法为磁珠法提取。以红刺玫基因组DNA为模板,优化SSR反应体系并确定反应条件,从22对SSR引物中筛选出扩增性强和稳定性好的有用引物12对;以有用引物进一步对红刺玫月季植物进行SSR,5对引物具有多态性,百分率为67~100%。该研究结果为红刺玫和月季亲缘关系分析、杂交亲本选择、以及杂交品系的鉴定奠定基础。

  • 标签: 红刺玫 DNA提取 SSR引物筛选
  • 简介:在天坛圜丘坛完整的前提下,从进入圜丘坛门开始,到祭天活动结束,主祭者和参与者们都经历过一个空间序列,产生过相应的联想。正是这个空间序列与产生过的相应联想,使天坛的圜丘坛在中国古人视野中更具有神秘的氛围,也给后人留下了古人宇宙观状况和巧妙营造空间氛围的信息载体。说其是一笔财富,也不为夸张。清乾隆皇帝冬至圜丘祀天,入圜丘坛门,经牺牲所西侧路与牺牲所南门前路,到南外坛西石牌楼。这是第一个拐尺形的空间。这一空间,始有圜丘坛门,沿途槐树夹道,树外右侧有外坛墙,左侧有牺牲所院墙,前有石牌楼。

  • 标签: 空间序列 空间环境 空间氛围 圆丘坛 圜丘 天坛
  • 简介:分别以雷竹嫩叶的基因组DNA和幼穗的cDNA为模板,采用PCR方法扩增出长为490bp及262bp的片段。序列分析结果表明,该基因序列包含1个长为228bp的内含子。其编码区共编Ns86个氨基酸。其氨基酸序列与水稻中OsFCA、小麦中TaFCA的一致性分别为79.8%与69.9%,表明雷伢中可能存在调控开花的自主调控途径。

  • 标签: 雷竹 OsFCA同源基因 开花 自主调控途径