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  • 简介:摘要目的建立武乡病毒(wuxiang virus, WUXV)的实时荧光定量TaqMan反转录聚合酶链式反应(real-time RT-PCR)检测方法。方法从GenBank中下载WUXV的全部基因序列,使用MEGA-X完成多序列比对分析,选择针对S段基因高保守区设计的引物和探针,分别对检测反应的特异性、灵敏性和稳定性进行评价。结果建立的方法可以特异性地检测WUXV,并且与多种虫媒病毒无交叉反应;反应的灵敏度较高,最低检测下限为1 pfu/ml;同一样品重复检测循环阈值(Ct)的批间变异系数均小于1.00%;用本研究建立的TaqMan RT-PCR检测30批白蛉核酸样本,其中7批出现WUXV阳性扩增曲线。结论本研究建立了灵敏度高、特异性强、重复性好的TaqMan RT-PCR方法可用于WUXV的大批量样本筛查。

  • 标签: 武乡病毒 实时荧光定量RT-PCR 检测
  • 简介:摘 要:气溶胶传播途径被世卫组织认为是造成大面积病毒传播的主要原因。且封闭空间内空气流通较弱,携带有病毒颗粒的气溶胶可以更长时间悬浮于空气中,从而易导致更高的病毒感染率。开发针对人员密集场所的一体化全自动的快速实时监测系统,将有望实现空气中病毒颗粒的高效富集和快速实时监测,遏制疫情蔓延。项目的成功实施,不仅可以有效解决环境病毒难以实时检测的问题,填补环境病毒检测领域的市场空白,而且可以促进核酸检测和气体检测设备跨行业的融合发展,催化相关技术领域的快速产业化发展。

  • 标签: 病毒气溶胶 环境检测 公共卫生 基础设施
  • 简介:摘 要:在此次疫情传播过程中,由于气溶胶颗粒可悬浮于空气中,并随空气流动扩散,因此气溶胶传播途径被世卫组织认为是造成大面积病毒传播的主要原因。封闭空间内空气流通较弱,携带有病毒颗粒的气溶胶可以更长时间悬浮于空气中,从而易导致更高的病毒感染率。本文讨论了气溶胶采样技术及现有PCR技术的发展水平,分析了开展病毒高效快速的检测与监控的现实可能性,解决如何在疑似高危险感染区域和人员密集场所(如医院、车站、商场)空气中及早发现潜在的传染源的现实需求。

  • 标签: 病毒气溶胶 环境检测 公共卫生 基础设施
  • 简介:摘要目的建立针对发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)、登革病毒(dengue virus, DENV)、汉滩病毒(hantaan virus,HTNV)三种常见病毒性出血热病毒的现场应急快速检测方法。方法基于传统的TaqMan荧光探针技术,利用国产快速一步法RT-PCR试剂盒,结合magnetic induction cycler (Mic) qPCR仪,建立三种常见病毒性出血热病毒的快速荧光定量RT-PCR检测方法。利用三种病毒体外转录RNA及模拟样本、其他相关病毒临床样本及健康人血标本进行灵敏度、特异性、重复性验证。结果相较于传统的实时荧光定量RT-PCR方法,此方法所需时间大大缩短,可在35 min内完成检测。SFTSV、DENV、HTNV的最低检出限均小于100拷贝/PCR,与模拟对照样本及其他病毒临床样本无交叉反应,模拟阳性样本验证均可检出,且各组验证结果的Ct值变异系数均小于4%。结论本研究建立的快速荧光定量RT-PCR检测方法具有良好的灵敏性、特异性和重复性。对于现场应急检测和媒介生物标本筛查具有一定的应用前景。

  • 标签: 发热伴血小板减少综合征病毒 登革病毒 汉滩病毒 快速荧光定量RT-PCR
  • 简介:摘要目的应用实时荧光RT-PCR和半巢式RT-PCR方法检测和分析牡蛎中诺如病毒的基因特征。方法应用实时荧光RT-PCR和半巢式RT-PCR方法,对2014年11月至2015年10月北京市采集的新鲜市售牡蛎进行诺如病毒GⅠ/GⅡ组并联试验检测,分析检出率,应用符合率和一致性检验(Kappa值)对半巢式RT-PCR方法进行可靠性评价,应用半巢式RT-PCR方法扩增诺如病毒GⅠ/GⅡ衣壳蛋白区基因,对阳性产物进行测序。采用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对、Mega 6.0软件构建进化树。结果72份样品中,实时荧光RT-PCR、半巢式RT-PCR和并联试验的诺如病毒检出率分别为31.94%(23/72)、38.89%(28/72)和48.61%(35/72)。2种方法符合率为73.61%,中度一致(Kappa值=0.43)。测序成功13株诺如病毒,11株(7株GⅡ.17、2株GⅡ.4 Sydney_2012、1株GⅡ.1和1株GⅡ.21基因型)为2种RT-PCR方法检测诺如病毒阳性样本所得;2株(GⅡ.17和GⅡ.3基因型各1株)为半巢式RT-PCR方法检测诺如病毒阳性样本、实时荧光RT-PCR方法检测诺如病毒阴性样本所得。这些毒株与腹泻患者、环境污水和贝类水产品参考株的相似性为84.4%~100.0%。结论用2种RT-PCR并联法检测牡蛎中诺如病毒,不仅能提高检出率还能获得更多基因型;牡蛎中诺如病毒毒株与人源、环境污水及贝类水产品参考毒株高度同源,应对经常接触牡蛎的人群及相关环境进行诺如病毒监测和防控。

  • 标签: 诺如病毒 实时荧光反转录聚合酶链式反应 半巢式反转录聚合酶链式反应 基因特征 牡蛎
  • 简介:摘要目的建立一种可单管同时检测新型冠状病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒和人源基因内标的一步法多重巢式荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法。方法收集2020年2月至2022年2月广州白云机场海关入境人员新型冠状病毒核酸阳性样本30份和336份排查样本,以及2020年发生新型冠状病毒肺炎疫情前3年期间同样来自广州白云机场海关入境人员的其他呼吸道病原体阳性样本64份和呼吸疾病国家重点实验室提供的呼吸道病原体阳性毒株7份。选取新型冠状病毒 ORF和N基因,以及甲、乙型流感病毒M基因的核苷酸保守区域,设计和筛选出多重巢式荧光PCR引物和探针组合,同时引入人源基因内标的巢式扩增引物和探针,建立一套多重巢式荧光RT-PCR检测方法,应用制备的假病毒阳性质控品和样本盘,评估方法的敏感度、特异度,并进行临床样本应用性验证。结果所建立的一步法多重巢式荧光RT-PCR方法可特异性检出新型冠状病毒和甲、乙型流感病毒,新型冠状病毒的最低检出限约为125拷贝/ml,甲、乙型流感病毒的最低检出限约为250拷贝/ml;检测101份各类呼吸道病原体阳性样本,显示新型冠状病毒和甲、乙型流感病毒的检测敏感度分别为96.67%、92.86%和96.15%,三者的特异度均为100%,超过300份临床样本的应用性检测中,未见假阳性检出。结论建立了一套新型冠状病毒、甲、乙型流感病毒和人源基因内标的一步法多重巢式荧光RT-PCR方法,该方法具有良好的灵敏度和特异性,可用于新型冠状病毒和甲、乙型流感病毒的大批量样本快速筛查。

  • 标签: 新型冠状病毒 流感病毒 核酸检测 多重聚合酶链反应
  • 简介:摘要目的利用Y型引物和荧光定量RT-PCR技术建立一种用于登革病毒(dengus virus, DENV)快速分型的四重荧光定量RT-PCR检测方法。方法用DENV四种分型体外转录RNA对该方法的灵敏度、特异性进行评价及用临床样本进行验证。结果DENVⅠ型、Ⅱ型、Ⅲ型和Ⅳ型最低检出限分别为5.01反应/PCR、6.16拷贝/反应、6.35拷贝/反应、6.39拷贝/反应,与单重实时荧光定量RT-PCR比,最低检测限无明显变化;且与其他病毒无交叉反应,临床标本的阳性一致率和阴性一致率均为100%。结论本研究建立的Y型引物四重荧光定量RT-PCR方法可有效避免不同DENV分型间的交叉反应,同时具有良好的灵敏度和特异性,可用于相关临床标本的DENV快速分型检测

  • 标签: Y型引物 四重荧光定量RT-PCR 登革病毒 基因分型
  • 简介:摘要:实时的荧光RTPCR检测技术,是在常规PCR平台上发展出来的量化PCR工艺技术,通过在PCR的反应系统中添加了大量荧光反应基团,之后再经过大量荧光数据的积累,就可以即时的监控了整个PCR流程,之后又利用x射线断层成像数据的标准曲线,对所有未知模型都实现了定性分析。

  • 标签: RT—PCR 活禽和禽组织 禽流感病毒 研究
  • 简介:【摘要】目的:对比RT-LAMP与realtime-PCR在手足口检测中的应用效果。方法:试验选取时间段为2020年5月~2021年6月,从我中心收治疑似为手足口病患儿86例,将其依据不同检查方法分为对照组与试验组,试验组使用RT-LAMP方法进行诊断,对照组使用realtime-PCR进行诊断,以两种方法联合检查作为金标准,比较两组的检出情况与敏感度与特异度。结果:对比检出情况与敏感度与特异度,试验组更佳。结论:在临床上采用realtime-PCR的检查手段对于手足口病更为灵敏特异。

  • 标签: realtime-PCR RT-LAMP 手足口病
  • 简介:摘要:食品安全不仅影响着民众健康,还能对我国食品业发展造成严重限制,为避免食品安全问题的频繁发生,有关部门十分重视食品安全检测,在检测之中灵活运用各种方法,但检测效果微乎极微,市场之中仍存在“问题”食品。为切实解决这一问题,本文提出PCR技术,先行提出该技术在食品检测中的应用意义,继而分析其在食品检测中的开展方法,最后指明其在不同食品与不同成分中的检测应用,以供参考。

  • 标签: 食品检测 PCR技术 应用分析
  • 简介:摘要:本文旨在介绍荧光定量PCR技术,并详细说明了其使用前的准备工作、操作流程和注意事项,为广大动物实验爱好者提供参考。

  • 标签: 动物实验检测 PCR技术
  • 简介:摘要:本文旨在介绍荧光定量PCR技术,并详细说明了其使用前的准备工作、操作流程和注意事项,为广大动物实验爱好者提供参考。

  • 标签: 动物实验检测 PCR技术
  • 简介:摘要:随着我国经济发展越来越好,人们的生活水平日益提高,人们为了身体健康越来越注重食品安全,因此提高对视频的生物监测能力是解决当下食品安全问题的关键。本文详细分析当前PCR技术在我国食品微生物检测过程中的具体应用,深入研究常用的食品检测技术,保证我国食品安全水平以及民众的生命安全。

  • 标签: PCR技术 微生物检测 食品安全 分析与应用
  • 简介:摘要:食品安全是公众关注的热点问题,也是世界公认的最难解决的公共卫生问题。近年来,随着经济水平的大幅提高,人们的物质生活比过去有了很大的改善,对食品安全也提出了更高的要求。如何提高食品微生物检测的结果和质量,已成为当前食品安全工作的发展趋势。常见的致病菌包括副溶血性孤菌和沙门氏菌等。对这些致病菌的高效检测可以有效保证食品安全。但要做好上述工作,需要成熟的检测技术。聚合酶链反应(PCR)因其方便、快速、灵敏而被广泛应用于食品微生物的检测。本文从PCR技术的应用特点出发,分析了PCR技术在食品微生物检测中的应用,希望能为食品检验人员和相关研究人员提供参考。

  • 标签: PCR技术 食品微生物检测 应用
  • 简介:摘要:在食品微生物检测工作中采用聚合酶链式反应(PCR技术时,应形成正确的技术应用认知,制定完善的技术方案,通过有效的措施提高食品微生物检测工作的效率,发挥现代化技术的作用,确保能及时发现食品微生物问题,并有效解决和应对,为保证食品质量、维护人们的身体健康和生命安全夯实基础。

  • 标签: PCR技术 食品微生物检测 作用
  • 简介:摘要:食品和药品的检验工作是食品药品安全性的关键部分。聚合酶链式反应(PCR技术的优点有:快捷、灵敏以及操作便捷等,因此它能够被广泛的应用于食品和药品的检测中。本文目的为探究PCR技术在食品药品检测中的应用价值。

  • 标签: PCR技术 食品 药品
  • 简介:【摘要】目的:新冠冠状病毒检测内使用PCR技术的效果。方法:从2020年2月-2022年10月疑似新冠5例新型冠状病毒肺炎患者作为实验研究对象,通过对研究人员展开回顾性分析。对患者使用PCR技术,分析检测效果。结果:PCR技术系统用于新冠病毒检测内,其检出阳性率较高,特异性以及敏感度较好。结论:将PCR技术用于新冠病毒临床检测内,可以根据其检查结果为医生提供部分数据依据,值得临床应用,但最终结果仍需结合其他数据以及患者症状确诊。

  • 标签: PCR技术 新冠病毒 核酸检测
  • 简介:【摘要】目的:探究荧光定量PCR在乙肝检测中的应用效果。方法:试验时间段为2019年3月~2021年4月,选取我中心收治的乙肝患者94例,客观性将其依照随机数字表法平均分为对照组与试验组各47例,对照组进行血常规,试验组进行荧光定量PCR检查,血常规作为金标准,比较两组不同检查方法的检出率与诊断时间。结果:检出率与检验时间均为试验组更佳,具有统计学方面意义(P<0.05)。结论:在诊断乙肝方面应用荧光定量PCR效果更好,具有良好的应用前景。

  • 标签: 血常规 乙肝 诊断效果
  • 简介:摘要:本文介绍了本所PCR质量检测实验室的建设和管理,包括总实验室设计、生物安全、实验室管理、人员培训和管理、室间质评和实验耗材等方面。目前该实验室已正常、有序投入使用,本文旨在为其他PCR实验室的建设与管理提供参考经验。

  • 标签: PCR实验室 生物安全 设计 管理