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  • 简介:为研究黄金茶出芽早的分子机制,本研究采用SMART-RACE技术,获得了与解除休眠相关的转录因子CsDAM2基因的全长eDNA序列,并进一步对该氨基酸序列进行了生物信息学分析。研究发现CsDAM2基因全长为1386bp,序列分析表明,该序列含有一个完整的编码区,大小为657bp,编码区GC含量为50.45%。此编码区可以编码分子量为24.86kD的亲水性蛋白,该蛋白由218个氨基酸组成,理论等电点(pI)为8.96。黄金茶CsDAM2蛋白有11个磷酸化位点,属跨膜蛋白,与毛白杨DAM3的相似性为71%,与已登录茶树MADS.box蛋白的一致性为35%。本研究为进一步揭示黄金茶春芽萌发早的分子机制提供了理论依据。

  • 标签: 黄金茶 CsDAM2基因 全长克隆 序列分析
  • 简介:为研究人血小板因子4(hPF4)的生物学性能和用于肿瘤生物治疗的可能性,运用反转录聚合酶链反应(RTPCR)从人红白血病细胞系HEL细胞总RNA中扩增出hPF4基因cDNA序列,将其克隆至pUC18载体中.序列分析证实克隆片段与文献报道的hPF4基因cDNA序列完全一致,说明已成功克隆到hPF4基因cDNA.

  • 标签: 人血小板因子4 CDNA克隆 序列测定
  • 简介:利用反转录聚合酶链式反应的方法,以单引物R2为引物,从水稻伴生菌中克隆到了一cDNA片段,长1029bp,其中开放阅读框部分共编码220个aa.NCBI核苷酸序列同源性比对结果表明:开放阅读框部分与大肠杆菌、志贺菌和沙门氏菌有较高的同源性,但在3'非翻译区几乎没有同源性;多肽序列的同源性比对结果显示,R2在N-端比目前已知的四氢叶酸脱氢酶/环化酶多肽序列少50个aa,C-端少18个aa.通过http:∥www.fruitfly.org网站下的启动子预测软件未发现转录起始位点,在3'端也无AATAAA加尾信号,因此我们克隆的cDNA不是完整的基因序列.通过功能结构域预测和三维结构分析表明:R2存在多个功能结构域,即FolD、KOG4230、THF_DHG_CYH_C、KOG0089和THF_DHG_CYH,其中KOG0089和THFDHG_CYH_C为R2蛋白所包含的完整的功能结构域,晶体模型显示其分子表面凹凸不平,分子内存在间隙,总能为-5243.076kJ/mol,存在两个GROMOS程序修复点即Gly53和Gly187,有7个类似于Ala83和Leu86的锚定连接形成两个环状结构.

  • 标签: THF 复点 BI 功能结构 锚定 预测
  • 简介:目的:建立一种适合以红花cDNA为模板进行相关序列扩增多态性(SRAP)扩增的体系,筛选最佳的SRAP-PCR反应条件。方法:提取红花RNA并反转录成cDNA,以此为模板,使用正交设计表设计PCR反应中的3个重要因素Taq酶、三磷酸脱氧核苷(dNTPs)、引物的反应浓度。随后设计Mg^2+的反应浓度以及模板含量,分别进行单因素试验。结果:本研究建立的红花cDNA-SRAP扩增条件为:25μL反应体系中含模板cDNA20ng,1×PCR缓冲液2.5mmol/L,Mg^2+2.0mmol/L,TaqDNA聚合酶0.04U/μL,dNTPs0.2mmol/L,引物0.2μmol/L。优化后扩增结果稳定性好,条带清晰,多态性好。结论:该体系为红花功能基因的研究奠定了基础。

  • 标签: 红花 CDNA 相关序列扩增多态性 分子标记 逆转录聚合酶链反应
  • 简介:P16ink4是CDK抑制蛋白,参与调控细胞G1期至S期的转换。目前发现P16`(ink4)基因损伤与多种肿瘤的发生、发展有关,可能是功能上非常重要的抑癌基因。为了研究该基因的功能,以及突变对该基因功能的影响,本文应用RT-PCR方法,从Hela细胞中克隆了P16ink4cDNA。扩增得到556bp片段(包括引物两端酶切位点的16bp)克隆于M13载体,测定了其DNA序列。该序列包括了P16ink4cDNA编码区全部471bp,以及3’端69bp序列。表明P16ink4cDNA已成功地得到克隆。

  • 标签: P16ink4/CDKN2/MTS1 CDNA 序列测定 RT-PCR
  • 简介:利用分子生物学方法,我们将K562细胞林bcr/ablmRNA0.3kb的接合区cDNA片段用聚合酶链反应扩增并插入到质粒pGEM-4-Z载体中。经限制酶切分析和荧光标记M13引物法DNA序列测定,证实重组质粒pB3A2中有0.3kb的插入片段与K562mRNA接合区序列完全一致。我们分离到的接合区DNA可用于bcr/abl基因的检测及其反义核酸抑制的研究。

  • 标签: BCR/ABL基因 接合区 序列分析
  • 简介:[背景]椰心叶甲啮小蜂在防治椰心叶甲危害上取得了重要成果,其耐低温胁迫能力将决定该寄生蜂是否能在低温环境下建立种群并发挥控害效能.筛选椰心叶甲啮小蜂低温胁迫下相关响应基因,可为揭示其耐寒性机理提供重要线索.[方法]采用抑制消减杂交技术,分别以经0℃处理24h后的试虫与未经低温处理的试虫.DNA互为t.st.r与driver,正反向构建椰心叶甲啮小蜂cDNA消减文库,经蓝、白斑筛选,鉴定阳性差异片段,并分别随机挑选正反向文库224和119个阳性克隆进行序列比对分析.[结果]本试验所构建的cDNA消减文库为椰心叶甲啮小蜂低温胁迫下特异表达的cDNA消减文库;经蓝、白斑筛选,分别得到了40和4个高质量ESTs,经PCR鉴定插入片段长度主要分布于200~700bp之间;序列分析结果表明,差异表达基因的功能主要涉及新陈代谢、细胞结构、信号传导、氨基酸和蛋白质合成的生理过程,并筛选出5类与啮小蜂耐寒性相关的基因,包括Hsp家族蛋白、海藻糖磷酸合酶、谷氨酰胺合成酶、ATP合成酶β亚基和NADH脱氢酶.[结论与意义]该研究对进一步研究椰心叶甲啮小蜂抗寒性状的表达具有一定的参考价值,为揭示啮小蜂抗低温耐寒机制打下一定的理论基础.

  • 标签: 椰心叶甲啮小蜂 差异表达基因 抑制消减杂交
  • 简介:对木头开发和形成的分子的生物研究是相关基因的发现的最近的年,而是步里的焦点,他们在木头性质的控制的函数是慢的。它在另外的工具上的高产量能力,敏感,和可靠性的优点为调查能够的基因表示patternsis开发了的microarraytechniquewith很快assaying几千基因。在这研究,从开发白杨木部纸巾的二个cDNA图书馆准备的cDNAmicroarray从Populusdeltoides的主要的茎在不同高度在不成熟的木部纸巾习惯于试金基因表示模式(15?岁),它被证实有不同木头性质(microfibrillar角度,木质的密度)旁边X光检查。有在薄片之间的微分表示侧面的274个抄本外面被屏蔽,并且单个克隆受到5定序。用生物信息的分析,我们识别了可以影响白杨木头性质的候选人基因,许多哪个属于各种各样规章并且信号transduction基因家庭例如锌手指蛋白质抄写因素,DNA有约束力的抄写因素,乙烯反应因素等等。结果建议这些基因可以调整涉及木头形成的酶。进一步的工作将被执行克隆这些基因并且决定他们怎么影响白杨木头性质。

  • 标签: CDNA文库 分子生物学 木材性状 微阵列分析 杨树 控制
  • 简介:十二音体系的建立,对传统的旋律组织法作了彻底的变革,在音乐中奠定了序列主义的基础。但作曲家们并没有满足于“音高”的序列化,为了创造全新的音乐语言,他们的下一个目标是彻底改革传统的“节奏”组织法。

  • 标签: 序列主义 音乐语言 二音 序列化 三十二分音符 布列兹
  • 简介:Phytohormoneabscisicacid(ABA)wascriticalformanyplantgrowthanddevelopmentalprocessesincludingseedmaturation,germinationandresponsetoenvironmentalfactors.WiththepurposetodetectthepossibleABArelatedsignaltransductionpathways,wetriedtoisolateABA-regulatedgenesthroughcDNAmacroarraytechnologyusingABA-treatedriceseedlingasmaterials(undertreatmentfor2,4,8and12h).Of6144cDNAclonestested,37differentialclonesshowinginductionorsuppressionforatleastonetime,wereisolated.Ofthem30and7wereup-ordown-regulatedrespectively.Sequenceanalysesrevealedthattheputativeencodedproteinswereinvolvedindifferentpossibleprocesses,includingtranscription,metabolismandresistance,photosynthesis,signaltransduction,andseedmaturation.6cDNAcloneswerefoundtoencodeproteinswithunknownfunctions.RegulationbyABAof7selectedclonesrelatingtosignaltransductionormetabolismwasconfirmedbyreversetranscriptionPCR.Inaddition,somecloneswerefurthershowntoberegulatedbyotherplantgrowthregulatorsincludingauxinandbrassinosteroid,which,however,indicatedthecomplicatedinteractionsofplanthormones.PossiblesignaltransductionpathwaysinvolvedinABAwerediscussed.

  • 标签: 水稻 ABA敏感基因 脱落酸 植物激素 鉴定 CDNA阵列
  • 简介:FemaleinflorescenceofBetulaplatyphyllawassampledatanintervalofeachtwodaystoanalyzethebackgroundofgeneexpressioninfloralphase.OnthebasisofSMARTstrategy,thedrivercDNAwasobtainedfromtotalRNAofthelastsampleandthetestercDNAwasfromthatoftheothersbyRT-PCRwhichweresubsequentlyusedtoconstructasubtractedcDNAlibrary.TheresultoftheESTs(expressionsequencetags)blastXshowedthatthegenesinthesubtractedcDNAlibrarycouldbemainlyclusteredinto5groupsrelatedtometabolism,transportationandsignaltransduction,cellcycle,stressresponse,andregulation.Therelationshipbetweengeneexpressionanddevelopmentwasalsodiscussed.

  • 标签: 白桦 雌花序 CDNA文库 SMART RT-PCR 基因表达
  • 简介:Objective:Toclonemultidrugresistance(MDR)relatedgenesinlungadenocarcinomacelllines.Methods:ThedifferentiallyexpressedcDNAfragmentsbetweenA549andA549DDPcellswereanalyzedbymRNAdifferentialdisplayPCR(DDRT-PCR).ThefragmentsthusobtainedwerefurtheranalyzedbyDNAsequencingandNorthernblotting.Results:ThreedifferentiallyexpressedcDNAfragmentswereobtainedandconfirmedbyNorthernblot.Sequenceanalysisrevealedthattwoofthemwerenovelandonewas100%identicalwithICEgene.Conclusion:AnalyzingdifferentiallyexpressedfragmentbetweenA549andA549DDPcellsmaybehelpfulforfindingnewMDRrelatedgenes.ThedrugresistanceofA549DDPcellsmayberelatedtotheinhibitionordown-regulationofICEgene.

  • 标签: A549 和 A549 DDP 房间 mRNA 微分显示 MDR 相关基因
  • 简介:目的:克隆COPS3基因cDNA,构建其原核融合蛋白表达载体并表达和鉴定。方法:从培养的人骨肉瘤细胞系SOSP-9607细胞中提取总RNA,经RT-PCR获得COPS3基因。将该基因克隆到pGEM-T-Easy载体中,酶切及测序鉴定。将COPS3基因插入pET28a融合蛋白表达载体中,IPTG诱导表达,进行SDS-PAGE分析。免疫印迹法鉴定COPS3蛋白的表达。结果:cDNA测序证明,获得了COPS3基因cDNA,其序列与Genebank中报道序列完全一致。酶切分析表明,成功构建了含COPS3基因的pET28a融合蛋白表达载体。SDS-PAGE以及免疫印迹法鉴定分析表明,COPS3蛋白获得高效表达,分子质量为51Ku,表达量约占菌体总蛋白的30%。结论:成功克隆和表达了COPS3cDNA

  • 标签: COPS3 CDNA 克隆 表达 骨肉瘤
  • 简介:TherootofPanaxginsengplantundergoesaspecificdevelopmentalprocesstobecomeabiosynthesisandaccumulationtissueforginsenosides.Toidentifyandanalyzegenesinvolvedinthebiosynthesisofginsenoside,weconstructedandcharacterizedafull-lengthcDNAlibraryfor6-year-oldNorthAmericanginseng.ThetiterofprimarycDNAlibraryis1.2×106pfu/mL,thetiterofamplifiedlibraryis2.6×1010pfu/mLandtherateofrecombinantisabove86%.Theinsertsizerangesfrom0.3to2.0kb.Sequencingresultsshowthat18of58genesarehighhomologoustothegenes(GBR5,GBR3andGBR1)knowninGenBank,whichareinvolvedinbiosynthesisofginsenosideinNorthAmericanginsengplant;16of58genesarenovelgenes.Thefull-lengthcDNAlibraryofNorthAmericanginsengroottissuesisessentialforthecloningofgenesknownanditisalsoaninitialkeyforthescreeningandcloningofnewgenes.

  • 标签: 西洋参 根部组织 CDNA表达文库 构建 特性 SMART
  • 简介:Objective:Toanalyzethechangesofgeneexpressioninphenylbutyrateinduceddifferentiationofgliomacells.Methods:Theexpressionlevelsof14000genesingliomacellsbeforeandafterinducementwithsodiumphenyl-butyratefor2hor6dayswereevaluatedbycDNAarraytechniqueandprovedbymulti-dotblotting.Results:expressionof98genesingliomacellsshowedchangesaftertheinducement.Somegenesinvolvedintranscriptionandtranslationandsomeoncogenesaredown-regulated,whilesomegeneinvolvedindifferentiationorapoptosisareup-regulated.18unknownexpressionsequencingtag(EST)changedtoo.Conclusion:Ageneexpressionprofileassociatedwithdifferentiationofgliomacellswasestablished.

  • 标签: 神经胶质瘤细胞 苯丁酸 诱导分化 基因表达 CDNA阵列
  • 简介:Throughexploitingthehighhomologyofcerealcropgenes,membranouscDNAmicroarrayscontaining3311uniquericetranscripts(including1639cndosperm-derivedtranscriptsand1672maturestem-derivedtranscripts)wereusedformonitoringtheexpressionprofilesofl-leafstageseedlingsof4cerealcropspecies:rice,maize,sorghumandbarley.Afterhybridizingwith[P]labeledprobes,73.6%ofthearrayedgenesgeneratedreliablesignalsinallofthefourcerealcrops.Furtheranalysisrevealedthatamongthearrayedgenes,ahigherpercentageoftheendosperm-derivedtranscripts(86.6%)expressedthanthatofthematurestem-derivedgenes(60.9%),indicatingthatmostoftheendospermexpressedgenesfunctionedinyoungseedlingswhilcconsiderableamountofmaturestemtissueexpressedgenesdidnotexpress.Theseresultsalsoinferredthatsomegenesmightfunctiononlyatcertaindevelopmentalstages.Bycomparingtheobtainedprofdes,84geneswereidentifiedconstantlyexpressedinallthefourcerealcrops.Manyhousekeepinggenes,suchaspolyubiquitin,ubiquitinconjugatingenzymeandribosomalproteinswereincludedinthiscatalogue.Theexperimentalsoidentified14riceseedlingspecificallyexpressedgenes,including3bioticandabioticstressinducedgenesand1apoptosissuppressorencodinggeneBaxinhibitor-1.Thisinvestigationprovidedinvaluableinformationforcomparativegenomicsofgramineaemembers.

  • 标签: 禾谷类农作物 幼苗 表达图谱 水稻 cDNA微序列
  • 简介:Twostarch-branchingenzyme(SBE)inrice,isknowntobeakeyenzymeinamylopectinbiosynthesis.ThecDNAoftwoSBE(starch-branchingenzyme)genesSheIandShedencodingSBEⅠandSBEⅢ(twomajorisoformsinrice)wereclonedbyanimprovedRT-PCRtechnique,fromatemplatecDNAlibray,derivedfromthetotalmRNAsextractedfromtheimmatureseedsofajaponicariceWuyunjing7.DNAsequenceanalysisshowedthatthesizeoftheclonedSheIandShedcDNAswere2490and2481bplong,respectively,includingtheirentirecodingsequences.ComparisonanalysisindicatedthatthenucleotidesequenceofShe3wasthesameasthatofshed(GenbankAccessionNo.D16201)asreportedpreviously.Therewereonlyfourbase-pairsdifference,whichresultedinchangesoftwodeducedaminoacidsbetweentheclonedShe1cDNAandthereportedshe1(GenbankAccessionNo.D11082).TheclonedSheIandShedcDNAsmakeitpossibletoimprovericestarchqualitythroughgeneticengineering.

  • 标签: 水稻 淀粉分支酶 基因 克隆 序列分析 CDNA
  • 简介:产生于20世纪上半叶的十二音序列,其基本原则已存在于晚期浪漫派及新民族乐派的作品中,甚至与13、14世纪的“等节奏”技术有着异曲同工之妙。在勋伯格建立起十二音体系之后,在不同作曲家的不同创作时期中,序列的发展从来没有停止过。它的极端表现形式是形成于50年代的整体序列,由于它对音乐的全面控制极大的束缚了作曲家的手脚,因而序列与各种不同风格的“调性”的结合,在作曲家和理论家们不断探索的过程中,越来越显示出强大的生命力。

  • 标签: 序列 十二音 特洛普 非十二音序列 结缘序列 关联序列
  • 简介:为了提高蓝牙跳频序列在军事通信抗干扰系统中的应用性能。文中给出了一种通过蓝牙跳频序列生成算法的改进得到的新型跳频序列。这种新序列与原来的蓝牙序列相比,其周期更长,数量更多,汉明相关性能和均匀性更好,线性跨距也更大。

  • 标签: 蓝牙 跳频 序列 军事通信 抗干扰